环境行政指导作为一种非强制性的行政管理手段，最早出现在二战后公害严重的日本，这一理论逐渐成熟之后传入我国并付诸于实践之中。然而在实践中，环境行政指导由于其自身灵活的特点，不易掌握和控制，导致了一些问题的发生。本人通过对其理论基础和成本效益的分析，论述环境行政指导理论存在的价值，对出现的问题进行深层次原因分析，并着重对环境行政指导进行多角度的监督设计，针对今后的指导实践构建一套监督机制，保证环境行政指导的合理决策和有效实施。本文共分四章，其结构如下：第一章首先介绍了行政指导产生的背景和契机。本人结合国内外专家学者对行政指导概念的总结，将其概念定义为：行政机关在其职权范围内，为达到一定的行政目的，在符合法律精神、原则、规则及政策的背景下，与相对方平等协商，采取希望、劝告、吁请合作等方式鼓励、引导相对方作出行政机关所希望的行为，并且不产生国家强制力或法律约束力的一系列行为的总称。而后，结合环境问题自身的特点，论述了环境行政指导的特殊性。第二章分析了环境行政指导的理论基础，介绍了行政法的几种主流学说，指出环境行政指导的理论基础是平衡论，并从三个方面阐述了平衡论在环境行政指导中的体现。此外，还从成本效益的角度分析了环境行政指导的优势，并介绍了它的分类及功能。第三章则指出了环境行政指导实践中出现的问题，概括了几种“扭曲”的指导，并从法律依据、程序设置、公众参与以及监督机制等方面揭示了环境行政指导理论的不足之处，同时也从深层次分析了产生问题的原因。第四章描绘了环境行政指导监督机制的具体设想，首先从程序上对其进行设计，以保证环境行政指导的程序公正；其次对环境行政指导的听证制度进行了规范，让听证制度能起到实效；而后引入了环境影响评价制度，这也是本文的创新点，结合规划、建设项目的环境影响评价，大胆提出了对环境行政指导也应当进行环评的观点，并对此类环评提出了流程和注意事项的建议；最后，则是从外部监督的角度，提出了如何加强人民群众、环保组织以及新闻舆论对环境行政指导的监督。