应用16SrDNA技术分析慢性鼻窦炎鼻腔菌群分布

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目的通过16S rDNA高通量测序技术,分析慢性鼻窦炎不伴有鼻息肉患者与正常人的鼻腔菌群分布特点,探索病原学诊断的新方法,为慢性鼻窦炎的防治提供新的思路。方法选取符合诊断标准的慢性鼻窦炎不伴有鼻息肉患者(CRSsNP)13例,鼻腔健康者5例,分别标记为病例组和对照组。鼻腔采样拭子(Nasal Swab)采集两组中鼻道分泌物作为标本,通过样本DNA的抽提与检测、PCR扩增16S-rDNA V4-V5区、Illumina MiSeq平台高通量测序,并运用mothur等软件进行鼻腔微生物多样性分析。结果本研究18个样本共测得597个OUTs,21个门(对照组16个,病例组20个),233个属(对照组149个,病例组212个)。其中优势菌门(含量>1%)对照组4个,病例组6个,优势菌属对照组15个,病例组20个。病例组和正常组鼻腔分泌物样本在细菌丰度和多样性方面无明显差异。两组共有的优势菌门是变形菌、厚壁菌、放线菌和拟杆菌,共有的优势菌属是葡萄球菌属、新鞘氨醇杆菌属、丙酸菌属、鞘氨醇单胞菌属和狡诈菌属。在门水平,厚壁菌门和梭杆菌门在病例组中具有更高丰度(P<0.05),而在对照组中变形菌门具有更高丰度(P<0.05)。在属水平,葡萄球菌属、链球菌属、梭杆菌属、棒状杆菌属、厌氧球菌、放线菌属在病例组丰度较高(P<0.05),寡养单胞菌属、芽孢杆菌属、pandorea等在对照组丰度较高(P<0.05)。优势菌属普氏菌中的产黑色素普雷沃氏菌在病例组丰度明显增高。(P<0.05)结论CRS病因复杂,致病菌种复杂多样,运用16S rDNA高通量测序技术可以准确检测各种菌群,分析病例组与对照组人群鼻腔微生物群落分布差异。结果提示厚壁菌、梭杆菌、普雷沃氏菌属的增多、变形菌的降低与CRS的发病有一定的相关性。我们推断CRS改变了鼻腔微生物群和细菌多样性,寻找到失调的菌群将为其提供病原学依据,而如何维持鼻腔微生态的平衡将为CRS的治疗提供新的思路。
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