康熙三年(1664年),著名的反天主教人士杨光先再一次向朝廷上告汤若望等人传布天主教“邪教”、编发新书等罪名,此次上告不同于顺治末年的多次上告,随着顺治去世,康熙初年四大臣辅政的政治倾向更为保守,进而爆发了清初最大的天主教教案“康熙历狱”。杨光先上告的理由之一即是由李祖白所著的《天学传概》一书。李祖白是明末清初著名的天主教徒,是汤若望的门人,清初供职于钦天监,《天学传概》是其在康熙二年所写的介绍天主教的传教书籍,书中有多处将中国经典与天主教义相比附的争议性观点。这些观点与之前明末清初的传教士和天主教徒们的观点大体一致,但是李祖白在书中的表述却较前人更为直白和清晰。“康熙历狱”爆发后,吏部、礼部、刑部等多方对此案进行了审理,审讯内容的重点从汤若望等人传布邪教、编发新书逐渐扩大到了天文历法及荣亲王葬期的选择问题,各方给出的判罚提议也随着审讯重点内容的转变而多次出现变更。李祖白因其著作《天学传概》而卷入“康熙历狱”,又因在钦天监供职和汤若望的特殊关系而进一步被牵连进荣亲王葬期问题,刑部等对其的判罚提议也经历了从流放到凌迟,再到斩立决的转变。李祖白最终死于“康熙历狱”。李祖白之死,是死于“康熙历狱”,更是死于中西思想文化的冲突和碰撞,但究其根本,李祖白是死于其对中西思想文化认识都缺乏理性与深度,而其对中西文化不恰当认识的集中思想表现则是其著作《天学传概》。