种子作为农业生产的基础环节，保证种业的高效可持续发展是农业生产的首要问题。新疆作为育种大省，其种子企业的发展有很大的晋升空间。因此我们研究种子企业的竞争力和可以开发的竞争点，以提高新疆种子企业的综合竞争力。本文以比较竞争优势理论、企业竞争能力理论等相关理论为基础，首先对种业市场进行分析研究，总结出种子行业的特征。通过实地调研，了解新疆种子行业现状，分析其有利优势及不利因素。采用主成分分析法，建立种子企业竞争力评价指标体系。针对种子企业特征，设立对应的指标条件，对种子企业的竞争力进行综合评价，并提出相应的对策建议。研究结果表明：（1）种业有着高风险、行业壁垒高、种子企业投入高、新品种育繁推周期长、地域限制强、行业利润高等特点；（2）新疆种业发展的优势：天然的制种宝地、制种基地规模化机械化、农作物制种水平高、法律政策支撑有力、政府的种业规划引导发展、举办专业“种交会”影响力不断扩大；（3）通过创新开发能力、市场发展能力、成长和抗风险能力三个层次选取了13个评价指标，利用主成分分析法对调查的25家种子企业进行竞争力评价，中小型种子企业发展落后，竞争力弱，一些种业企业发展模式存在问题。（4）针对新疆种业的现状，提出了相应的对策建议：加强科研创新提高品种质量，重视企业种子营销工作提高种业市场份额，树立企业品牌形象提升品牌的核心竞争力，加强企业整合重组提升种业综合实力，培养企业文化促进社会和谐发展，加大政策扶持力度促进新疆种业发展。