玫瑰(RoSa rugosa Thunb．)是国家二级保护植物，是蔷薇科观赏植物天然的种质资源，具有重要的经济和生态学价值。由于人类活动对环境的破坏，使大连长山岛原有的大片玫瑰种群片断化，使其遗传多样性和遗传结构受到严重影响。本文以大连长山岛的玫瑰种群为研究对象，选取了17个)A(CSDl～CSD17)，148株样品，用RAPD标记对种群遗传多样性和遗传结构进行分析，并讨论了该种群受威胁的原因，提出了相应保护对策。 本文通过14个随机引物共扩增到162个显性位点，其中多态位点148个，4个位点表现出丛的特异性：丛内多态位点百分比(P)的平均值为22.59﹪，平均每个位点的有效等位基因数(Ne)为1.1387，丛内Nei’s基因多样性指数(H)为0.0803，这在以克隆繁殖为主的植物中是比较低的。种群内多态位点百分比(P)达91.36﹪，基因多样性指数(H)为0.2690，Shanon信息指数(I)是0.4412，这说明大连上山岛玫瑰种群具有比较高的遗传多样性。丛大小与丛内多态位点百分比(P)、Shannon信息指数(I)，呈显著正相关。仅在一个丛检测到基因型完全相同的植株。 对种群遗传结构和遗传分化的研究结果表明，各位点在丛间基因分化度(C<,ST>)的波动范围是0.014～0.9743，在各位点分化程度差别很大，平均值为0.6954：丛间基因流(Nm)波动范围为0.0000～34.9826，平均值为0.2190，远小于1，说明丛间基因交流较小，遗传漂变较大。 由遗传一致度和遗传距离的无偏差统计表明，在17个丛中，最小的遗传距离是0.1006，在丛CSD4和CSD5之间；最大的遗传距离是0.3803，在丛CSD3和CSD16之间；Mental检测表明遗传距离与空间距离呈明显正相关。由哈一温平衡检验结果分析，占总位点数的80.25﹪，说明有80.25﹪的位点严重偏离随机交配。 与其它地区种群相比，大连长山岛野生玫瑰种群分布范围较大，生境相对较好，遗传多样性水平高，但在部分海岸线也存在生境的破坏及退化，导致玫瑰分布区片断化，种群规模减少，进而可能会导致在遗传漂变的作用下使其遗传多样性逐渐丧失。建议对其采取适当的就地措施，规划保护区，保护海岸植被与生境，促进种群恢复，并辅以人工保育以加大丛间的基因流。