沼泽红假单胞菌HN1菌株bchCXYZ橾纵子调控机制研究

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沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris)菌体营养丰富,可以利用光能产生ATP为其生长代谢供能,被广泛应用于水产养殖、污水处理及生物能源等领域,因此对其光系统表达调控的研究尤为重要。沼泽红假单胞菌的bchCXYZ操纵子不仅自身是编码光系统中细菌色素合成的重要基因,而且与其下游编码光系统核心复合体蛋白的pufBALM操纵子共转录,因此bchCXYZ操纵子的表达调控对光系统的形成有重要影响。本研究中以实验室分离的高效产氢紫细菌沼泽红假单胞菌HN1菌株的bchCXYZ启动子区为研究对象,通过细菌单杂交技术研究了其调控蛋白,具体结果如下:1.克隆到了沼泽红假单胞菌HN1菌株中的PpsR1蛋白,序列分析发现此PpsR1蛋白与已研究的沼泽红假单胞菌CGA009菌株中的PpsR1蛋白由于碱基插入或缺失造成读码框发生变化,同时序列分析还发现不同菌株中PpsR1的DNA结合结构域非常保守。克隆到了沼泽红假单胞菌HN1菌株的bchCXYZ基因的启动子,发现在其启动子附近具有PpsR蛋白潜在结合位点,并且该位点与Bradyrhizobium sp.ORS 278菌株bchCXYZ基因启动子区的PpsR结合位点类似,因此推测克隆到的PpsR1蛋白可能调控bchCXYZ操纵子的表达。2.利用细菌单杂交技术,构建了融合表达载体pB1H2ω2-PpsRHTH及报告载体pH3U3-bchp,研究PpsR1与bchCXYZ操纵子启动子区域的互作。在pH3U3-bchp载体报告基因自激活的情况下,分别转入融合蛋白ω2-PpsR与ω2-Zif268发现,ω2-PpsR蛋白抑制了菌落的生长;通过ω2-PpsR毒性及报告基因表达情况研究说明,ω2-PpsR蛋白通过与bchp互作并抑制其自激活,使pH3U3-bchp与p B1H2ω2-PpsRHTH杂交菌株菌落减小。3.利用Wolfe实验室构建的细菌单杂交系统,首先改造其融合表达载体,构建了pB1H2ω2-MCS载体用于文库构建;而后使用上述产氢紫细菌沼泽红假单胞菌HN1菌株的基因组构建了基因组文库;最后构建了一系列bchCXYZ操纵子启动子不同区域的载体作为诱饵,并筛选了基因组文库。综上所述,本文通过克隆并分析沼泽红假单胞菌HN1菌株的PpsR1蛋白基因及bchCXYZ操纵子启动子区域,推测PpsR1可能调控bchCXYZ操纵子,通过细菌单杂交证实了PpsR1蛋白对bchCXYZ的调控,最后构建了基因组文库并用bchCXYZ操纵子启动子区序列为诱饵筛选了互作蛋白,为未来发现新的调控蛋白打下了基础。
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