中国的基础研究与科技创新正在经历从跟跑到领跑的历史性转身阶段。虽然中国基础研究取得了长足发展,但与主要发达国家相比,整体实力仍有差距,主要表现在两个方面:一是具有国际影响力的重大原创成果偏少,二是引领科学潮流的世界级科学家匮乏,科学人才与团队培养尚有不足。创新研究群体作为国家自然科学基金资助的基础研究前沿创新团队,承担着科学前沿突破与人才团队培养的重要使命。创新研究群体作为顶级科研创新团队,秉持基础研究前沿性与人才培养使命,实现预期绩效与持续发展的关键是“深层合作”。精细分工与谋取声誉是深层合作的基石,创新研究群体团队合作机制主要包括分工机制与声誉机制。分工机制主要表现为成员搭配与效用互补,包括团队结构合理性与团队合作质量,声誉机制主要表现为成员互利共享与创新群体成功,包括团队绩效、个人成功与综合影响力。而在创新群体项目与团队的实际发展中,除了较显著的成效外,经研究实际调研与专家学者评估等形式发现,创新群体存在着“结构失范”与“合作低效”的情况,部分群体未能形成科学、合理、有效的团队合作机制,制约着创新群体的发展。本文基于交易成本理论、科学社会学理论、团队相关理论、社会网络理论等理论视阈,运用理论推理、实证分析、案例研究、科学计量等方法,对创新群体的组织性质与治理结构、合作网络的形成与演化、合作网络的构型与分类、团队合作机制的影响因素及作用机理等内容进行了较为系统的探索与研究。打开创新群体合作与发展的“黑箱”,解答问题并认清内涵规律,是实现创新群体团队合作机制完善与提升的关键所在,有助于实现团队资源的合理配置、信息有效与激励兼容,有助于实现科学研究进展与人才团队培养的目标。首先对本研究涉及相关理论基础进行了梳理与综述,特别是“创新研究群体”相关理论与“团队——团队合作——团队合作机制”相关理论。对创新群体、创新群体团队合作机制的内涵概念进行了挖掘与界定,并且基于理论融合与研究内容构建各部分研究的理论模型与分析框架,提出了创新群体的“组织性质与治理结构——合作网络的形成与演化——合作网络的构型与分类——团队合作机制的影响因素”这一技术路线与研究进路。其次,基于扩展的交易成本治理结构五重维度分析框架,提出创新群体是介于“小科学”与“大科学”组织间的中间组织,是稳定性与持续性较强的科研合作网络组织,其治理结构理想走向为网络治理。随后基于科学共同体演化与团队生命周期理论,将创新群体的合作网络演化过程,归纳为“三个阶段、两个转折点”:“无形学院”——经过“立项转折点”后成为“科研创新项目团队”——经过“变异转折点”后跃迁为“混合型学术共同体”。在合作网络构型上,运用知识图谱可视化分析等科学计量学方法,提出优秀群体晶格结构具有“单晶核辐射型”与“多晶核均衡型”两种形态,主要成员合作方式分别为“主导型领军人物+追随型研究骨干”与“协调型领军人物+准晶核研究骨干”两类。在创新群体团队合作机制的影响因素与作用机理分析部分,提出团队合作的深层机制主要包括分工机制与声誉机制,构建了创新群体团队合作机制的测量题项与评价指标体系,包括了团队结构合理性、团队合作质量、团队合作机制与创新群体成果等因素,实证研究表明团队合作机制是团队合作质量、团队结构合理性与创新群体成功之间的关键调节因素与中介变量;合理的团队结构、高水平的团队合作质量,经过良好团队合作机制的过渡,能够有效促进创新群体成功最后,从创新群体的组织性质与治理结构选择、合作网络的形成与演化机理、合作网络的构型与分类、团队合作机制的影响因素等视角出发,给出了创新群体团队合作机制的促进策略与政策建议。