中国被孢霉属及近缘属的分类与分子系统发育研究

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被孢霉属(Mortierella Coem.1863)隶属于真菌界,接合菌门,被孢霉纲,被孢霉目的被孢霉科。该属真菌全球广泛分布,生物多样性丰富,在生物技术和生物转化上具有重要的价值,同时还引起动植物病害。我国目前采用的被孢霉属分类系统仅依据形态特征,而当今系统学已经进入形态结合分子的时代。虽然真菌首选分子条形码ITS r DNA已经得到广泛应用,但仍然无法解决所有问题。随着生物资源的全球化,辅助分子条形码的筛选日渐成为必需。为了给工农业提供支撑,本文开展我国被孢霉属形态分类和多基因分子系统发育学研究,并籍此筛选其辅助分子条形码。形态上,本文在被孢霉属已有的6个组之外,建立了一个新的Indohii组。分离和收集到中国被孢霉总计376株,鉴定出43个分类单元,含8个中国新记录种和8个疑似新种。中国新记录种包括类变形被孢霉(Mortierella amoeboidea)、南极被孢霉(M.antarctica)、贝勒被孢霉(M.bainieri)、贝科瓦被孢霉(M.beljakovae)、球詹金氏被孢霉(M.cystojenkinii)、纤细被孢霉(M.fimbricystis)、巨囊被孢霉(M.macrocystis)和华美被孢霉(M.pulchella)。本文对8个疑似新种进行了宏观与微观形态的详细描述并进行了图示,对比讨论了相似种间的区别,更新了中国被孢霉属分组和分种检索表。多位点分子系统发育分析显示,被孢霉属并非单系群,隔丝霉属(Dissophora)、小加姆斯霉属(Gamsiella)和裂孢囊霉属(Lobosporangium)等三属并入其中。因此,本文将这些属作为被孢霉属的异名处理,同时进行相应物种的新组合处理。根据种间分子系统发育关系,本文认为孢囊孢子的形状并不具有系统发育信息,在分类系统中应该作为次要的形态特征,而具有系统发育信息的孢囊梗分枝情况应该作为主要的形态特征。基于PCR扩增和测序成功率、系统发育信息、平均种内和种间相似率等指标的综合评估,初步筛选出LSU r DNA作为被孢霉属的辅助分子条形码。通过本文的研究,对被孢霉属分类系统进行了更新和修订,建立了新组,报道了中国新记录种,发现了疑似新种,重建了其分子系统发育历史,重新评估了其形态特征,初步筛选出该属辅助分子条形码。论文丰富了我国该类群真菌资源,研究结果对我国有益被孢霉的开发和有害菌的防治奠定了基础。
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