现今高等教育受到国家大力支持，发展飞速。发展过程中高校逐步暴露出一些问题，究其原因，主要是高校内部控制存在问题。内部控制工作起源早，并随着经济发展被不断完善，良好的内部控制对于预防经济犯罪、提高组织管理水平、增强组织竞争力来说意义重大，但我国高校此前从未有过完整、独立的规范性文件，为高校的内部控制执行造成不便。高校的内部控制问题应当从根本上得到重视和规范。本文分析了国际上和我国的内部控制制度的演变，找到内部控制产生及存在的必要性、可行性，良好的内部控制能够为组织的平稳发展保驾护航。2012年，财政部颁布了《行政事业单位内部控制规范（试行）》，并规定于今年开始实施。该规范是我国第一次以行政命令的方式确立高校的内部控制体系。本文立足于我国最新出台的《规范》。通过对《规范》的研究学习，结合我国内部控制工作现状，分析出我国高校内部控制在风险评估、单位层面、业务层面、评价监督方面存在的诸多问题，并找出这些问题存在的原因。根据《规范》对这些存在的问题提出适当的解决方案，从而完善我国高校的内部控制体系。