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目的本研究通过流行病学资料结合分子基因进化分析探讨福建省同性和异性传播人群HIV-1毒株传播关系和我省艾滋病流行态势,通过基因耐药性检测了解我省HIV-1毒株耐药本底情况。方法1.收集2012-2015年间部分确证新发现的HIV/AIDS,通过提取核酸,扩增基因gag和pol片段、序列测定获得基因序列。运用MEGA等软件构建系统进化树分析基因亚型,运用系统进化分析并结合流行病学资料分析同性传播和异性传播人群系统进化特征和传播关系。2.对上述序列pol片段使用HIVdb Program进行原发性耐药分析,比较同性传播和异性传播人群耐药相关突变位点的区别。结果1.流行病学特征结果显示同性传播人群与异性传播人群相比具有更年轻,文化程度更高,未婚比例更高等特征。对185例MSM人群性行为特征结果显示:35%MSM有过双性性行为,与非婚（临时或商业性的）异性性接触史占21.0%;首次发生同性性行为的平均年龄为23.0岁;记忆中发生同性性行为同伴的个数为12.8,最近一年发生同性性行为同伴个数为2.58,多性伴的情况较普遍;过去3个月,与临时（或商业性的）男性同性性伴发生性行为安全套使用率为38.2%,与临时（或商业性的）男性同性性伴安全套使用率为35.7%,发生同性性行为时安全套使用率较低。2.亚型结果显示:目前我省HIV-1毒株亚型种类多样,以CRF01AE和CRF07BC为优势流行毒株,同时还发现了CRF5501B、CRF08BC、B亚型、CRF02AG等亚型。值得注意的是在同性传播人群中CRF5501B亚型已占8.6%,异性传播中仅为1.6%,同时在异性传播人群中发现的15例CRF08BC亚型未在同性传播人群中发现。3.同性和异性传播人群系统进化和流行病学资料传播关系显示:（1）crf01ae系统进化分析:a)无论在异性传播人群还是同性传播人群中,没有发现序列在某个地区完全聚集;b)从进化树发现的58.4%（59/101）异性传播序列独立成簇。异性传播剩余42条序列（占41.6%）与同性传播人群序列交叉一起,散在分布。c)在同性传播人群中发现了4个高度聚集传播亚簇推测同性传播人群发生在流行圈的快速传播。d)福建省2005-2007年21条pol区crf01ae异性传播全部与本研究得到的异性传播相对独立的进化簇聚在一起。e)对我省部分crf01ae亚型毒株报告最高同源性的序列,结果显示,我省crf01ae亚型在异性传播中主要与广西地区毒株有着较为密切的传播关系,在同性传播中与广东和北京地区有着较为密切的传播关系。（2）crf07bc系统进化分析:a)同crf01ae一样,无论在异性性接触人群还是同性传播人群中,没有发现序列在某个地区完全聚集;b)从进化树上可以发现28.8%（15/45）异性传播序列独立成簇,提示该亚型异性传播人群存在一个相对同性传播人群独立的流行人群;c)进化簇2包含了同性传播人群72条序列,28条异性传播人群序列。从进化树看未发现拓扑结构,提示我们crf07bc在我省同性传播人群中流行可能是由多毒株引起。d)对我省部分crf07bc亚型毒株报告最高同源性的序列,结果显示,我省crf07bc亚型在异性传播中主要与广西地区毒株有着较为密切的传播关系,在同性传播中与广东和北京地区有着较为密切的传播关系。（3）crf5501b系统进化分析:研究分别共得到了20条crf5501b亚型pol区和gag区基因序列,同性传播占了绝大部分有17条,异性传播3条。发现了两个传播簇,簇1平均年龄25岁,文化程度以高中或中专以上为主,未婚为主,现住址均为厦门。其中包含一个异性传播病人编号d-hl10,推测其谎报男男性行为史的可能性大。簇2由三个泉州病例组成,3个病例平均年龄41.7岁,两位职业为工人,一位为民工,初中文化程度,户籍所在地均为外省,提示他们之间性活动活跃。（4）b亚型系统进化分析:发现了2个进化簇。簇1由4条泉州序列和1条福州序列聚集成簇,该簇全部为异性传播序列,平均年龄49.2岁,均是已婚有配偶,初中及小学学历为主,现住址及户籍地均为泉州地区。簇2由6条泉州序列聚集成簇,bootstrap达100%。该簇6条全部为同性传播序列。经流行病学调查显示:6个病例平均年龄34.8岁,职业以工人及民工为主,5个病例户籍所在地均为外省,提示他们之间可能有着密切的传播关系。（5）crf08bc系统进化分析:本研究得到14条异性传播人群序列crf08bc基因序列,其中福州5条,泉州1条,厦门8条。流行病学调查显示:14个病例有5例为女性（5/14,占35.7%）,平均年龄42.9岁,学历以小学及以下为主,有7例,职业以家政及服务业、农民和民工为主,猜测与从事低端性服务有关。同源性分析显示与云南毒株有着较为密切的关系,。（6）异性传播中11对双阳家庭系统进化树以及基因距离判断传播关系:在系统进化树上10个配对样本以近乎100%bootstrap值独立聚集,提示这些双阳家庭以家庭内传播为主。计算所有配对样本的基因距离,组内平均遗传距离均值pol区、gag区和env区分别为0.013,0.018和0.032,该数据为配偶间是否具有传播关系提供依据。流行病学调查研究显示,男方传播来源为商业婚外异性性接触史。学历以小学为主,职业以农民为主,推测是男方的婚外行为史感染hiv,然后将其传播给女性配偶,提示我们应该加强对配偶的告知。4.对共获得366例分离株的pol基因序列经基因型耐药检测发现36例患者出现耐药,耐药发生率为9.8%,其中同性和异性传播人群耐药发生率分别为9.73%和9.94%。非核苷类逆转录酶抑制剂耐药率为主,同性和异性传播人群耐药发生率分别为6.49%和5.52%。同性传播主要耐药突变为e138g（6次）和v179e（6次）为主,异性传播人群主要耐药突变为l33f（3次）和v11i（2次）。通过耐药研究提示注意未进行抗病毒治疗患者原发性耐药株的流行与传播,定期进行耐药性监测以便能合理和及时规范的抗病毒治疗。结论1.同性传播人群具有更年轻、化程度更高、未婚比例更高、异性性行为比例较高和安全套使用率低等特征。2.目前我省hiv-1毒株亚型种类多样,发现crf01ae、crf07bc、crf5501b、crf08bc、b亚型和crf02ag等亚型。3.由于msm人群双性性行为的存在,该人群中还存在一定比例的包括配偶在内的异性性伴,存在着通过“桥梁人群”向家庭内及社会上二代续发感染传播的风险,但我们估计这种比例不高,msm人群和异性传播人群更多以呈现相对独立传播的状态。1)异性传播人群中发现对于双阳家庭HIV传播以家庭内传播为主,提示我们对于感染HIV的患者需加强配偶告知2)异性传播毒株与广西和云南等地有着较为密切的传播关系3)同性传播人群发现7个传播簇,提示男同聚集的快速传播,需加强干预。户籍地为外省,离异或丧偶为其HIV感染的危险因素4)同性传播毒株与广东和北京等地有着较为密切的传播关系4.我省目前未抗病毒治疗HIV感染者/AIDS原发性耐药率为9.80%,同性和异性传播人群耐药发生率分别为9.73%和9.94%。同性传播主要耐药突变为E138G（6次）和V179E（6次）为主,异性传播人群主要耐药突变为L33F（3次）和V11I（2次）。同性传播人群中出现了6例患者高度耐药,异性传播人群出现了4例,均是针对NNRTIs的EFV和NVP,亟需加强监测。