【摘 要】
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孕烷X受体(PXR)作为一种关键性转录调节因子,调控体内大量内源和外源性结构不同的化学物质的代谢与排泄。PXR的活化作用影响各种蛋白酶的表达与代谢,包括细胞色素酶P450、谷胱
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孕烷X受体(PXR)作为一种关键性转录调节因子,调控体内大量内源和外源性结构不同的化学物质的代谢与排泄。PXR的活化作用影响各种蛋白酶的表达与代谢,包括细胞色素酶P450、谷胱甘肽转移酶以及一些重要的药物转运蛋白,如多药耐药蛋白(MDRs)、多重耐药蛋白(MRPs)和有机阴离子转运多肽酶(OATPs)等。1-7临床药物能够激活PXR,加速体内其他药物的代谢与排泄,引发药物之间的相互作用。因此,对PXR的激动剂进行分类预测研究,有助于进一步了解PXR与活性小分子间的相互作用原理,同时也为研究发现药物之间相互作用机制提供理论依据。在本论文中,基于532个结构差异性较大的化合物,我们综合性的分析了朴素贝叶斯分类技术对PXR激动剂和非激动剂的分类预测研究。我们首先研究了8个较为常见的分子物理化学性质描述符对PXR激动剂和非激动剂的分类能力。研究发现表征分子疏水性特征的相关参数(AlogP、logD)较之其他6个分子性质参数具有更好的分类预测能力。随后,基于不同分子物理化学性质描述符、Volsurf描述符和分子指纹描述符构建朴素贝叶斯分类模型,对PXR激动剂和非激动剂的分类进行研究。研究结果发现分子指纹描述符的引入能够提高分类模型的预测精度。基于21个分子物理化学性质描述符、Volsurf描述符和分子指纹LCFC10描述符所构建的贝叶斯模型的预测精度最高,对训练集中92.7%的分子可以准确预测,对预测集中85.2%的分子可以准确预测。最后,在贝叶斯分类模型的构建中得到对分类贡献不同的分子片段。研究发现,分子柔性是PXR激动剂的一种重要结构特征。除此以外,激动剂中含有多种卤素原子和具有π-π共轭作用的不饱和烷烃链。本论文报导的朴素贝叶斯分类模型能够为PXR激动剂和非激动剂的高通量虚拟筛选提供可靠的研究工具。
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