随着中国医药经济的不断发展，行业体制改革的不断深入，医药行业暴露出诸多问题，尤其是作为医药行业中的重要组成部分——医药流通企业面临着生存的危机。医药流通所存在的问题，究其原因是建立在传统物流概念下的医药物流运营模式已经不能适应现代医药经济体系发展的需求，因此，结合中国医药行业的实际情况，建立新的医药物流运营模式成为当务之急。 本文运用系统工程的分析方法，将医药物流作为一个系统工程进行研究。并重点研究了如下三个部分内容： 1、中国医药现行物流系统的概况及特点。 从传统计划经济体制转型而来的医药流通行业带有明显的“中国传统”特色；加之对于医药物流这一新概念本身认识的不足，研究现行的医药物流系统就必须了解的医药物流体系的基本概况及其特点。该部分内容主要分为两个部分：一方面是医药物流系统自身的概念和特点；另一方面是近年来，我国医药物流系统建设的情况和存在的问题。 2、现代医药物流运营模式的发展进程及趋势。 我国医药物流从最初的自营物流模式，发展到专业的第三方医药物流企业的出现，现代医药物流模式在不断更迭，所以研究现代医药物流运营模式的发展及趋势对于医药流通行业有着重要的意义。同时，借助霍尔模型模拟构建医药物流系统，通过分析现有医药物流运营模式及其特点，展望将来医药物流的继续发展方向，即向电子商务模式下的供应链、第四方、第五方发展。 3、中国现代医药物流运营模式的对策分析。针对现代物流发展的现状及未来的趋势，分析特殊的外在市场环境和行业环境以及医药物流企业内部的诸多现实运营情况，就医药物流电子商务模式、医药物流第三方模式、医药物流供应链模式三种情况制定出对策方法，并总结出适合我国医药物流基于电子商务运营模式的发展对策。 本文的主要理论方法是系统工程中的霍尔三维结构思想，主要通过借鉴霍尔三维模型这一系统工程的理论分析工具，对我国现行医药物流运营系统进行深入剖析，模拟构建出我国的医药物流系统。经过确立该模型的三个维度，即医药物流的时间维、知识维和逻辑维(运营模式维度)，对医药物流系统构成的相关元素进行详尽的探究与分析，从而总结出医药物流模式的发展规律轨迹，并据此推导出未来医药物流的变化趋势。同时，结合目前最新的物流理念——电子商务技术支持供应链协作系统的理论，依据模型推导出的医药物流变化倾向，对现有的医药物流运营模式进行优化提升，最终提出基于电子商务平台为基础的第五方医药物流运营模式的新策略，为中国医药物流指明了发展的方向。