虎mtDNA cyt b 和D-loop区序列特点及其在亚种识别中意义的研究

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liuwanfu2006
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本文克隆并测定了13只东北虎mtDNA D-loop区381bp的序列,并对这些序列和GenBank中注册的2个东北虎D-loop区序列和32个虎cyt b基因全序列(包含4个亚种)进行了分析,研究了cyt b基因和D-loop区序列的特点及其在亚种识别中的价值。研究发现,测得的东北虎D-Loop区381bp的序列中共发现79个变异位点,共有(?)个单倍型;D-Loop区中存在着两种序列:一是与其他物种同源性很高的“正常序列”,称为“短序列”;二是带有22bp的插入片断的“非正常序列”,称为“长序列”。11个“短序列”间同源性在99.5%~100%;4个“长序列”间的同源性在98.5%~99.2%;“短序列”和“长序列”间的同源性为75.5-81.6%。上述发现表明,在选择亚种识别遗传标记时,应区别对待D-loop区的两种序列;本文所研究的区域因为两种序列间的差异很大,所以不适合用作系统进化的分析。在32个虎mtDNA cyt b 1140bp的序列中,共发现14个位点存在变异,占总序列的1.23%,个体间序列的同源性在99.3~100%,平均为99.6%,没有发现缺失或插入。在cyt b基因上共检出10种单倍型,各亚种均有特有的标志性碱基,亚种间无共享单倍型。这表明mtDNA cyt b基因非常适合虎亚种识别;本文提出了cyt b基因上识别东北虎、孟加拉虎、印支虎、苏门答腊虎4个亚种的特异性单倍型。
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