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测量蛋白质分子功能基团间的距离在蛋白质结构与功能研究中具有重要意义。电子顺磁共振(Electron Paramagnetic Resonance, EPR)结合定点自旋标记(Site Directed Spin Labeling,SDSL)技术已成为测量蛋白质特殊位点间距离的重要方法之一。该项技术自诞生以来,已经在蛋白质结构与功能以及运动性等领域得到了广泛应用。目前在EPR距离计算中广泛使用的傅里叶去卷积距离计算方法(Fourier Deconvolution Distance Measurement, FDDM)在某些特殊实验条件下会产生计算误差较大或需要人为设置一些关键参数,从而影响计算结果的客观性等问题。为了克服FDDM方法存在的问题,本课题在其基础上提出波谱拟合—傅里叶去卷积距离计算方法(Spectrum Simulation-Fourier Deconvolution Distance Measurement, SS-FDDM)。首先根据课题提出的SS-FDDM距离计算方法的原理,开发了EPR波谱拟合距离计算软件。软件采用模块化设计,主要由两大模块组成——波谱拟合模块和距离计算模块。波谱拟合模块用于拟合快运动谱、慢运动谱、粉末谱3种单一成分波谱,以及由任意2种单一成分波谱组成的复合谱。通过对线宽与线型参数以及A张量的调整,基本实现了对未偶自旋相互作用导致的连续波谱线增宽效应的拟合,为SS-FDDM方法的实现创造了条件。距离计算模块是将波谱拟合模块与FDDM距离计算方法相结合,并可分别单独应用,根据实验波谱的情况即可以使用SS-FDDM方法也可以使用FDDM方法进行距离计算,可以计算的距离范围是0.8~2.5nm。所有操作都可在图形界面下完成,易于使用。该软件在Matlab环境下开发,具有易维护、可扩展性强等特点。使用编写的EPR波谱拟合距离计算软件对SS-FDDM与FDDM方法进行了实际距离计算的比较,主要比较了实用性、抗噪能力和磁场偏移修正能力等。结果表明,SS-FDDM方法能一定程度地克服原方法存在的不足,减少了由谱偏移和高噪声带来的误差,并避免了FDDM方法中需要选择增宽函数参数的过程,减少了人为干预,使计算结果更加准确客观。通过构建一组不同浓度自由基冰冻溶液模型(利用改变浓度来模拟距离的变化),对SS-FDDM方法进行了实际距离计算的测试,计算的结果与模型的理论距离基本吻合,验证了该方法是实际可行的。下一步将对SS-FDDM方法在实际生物大分子上进行位点间距离计算的测试。