本文对从广西全州县咸水林场、广西高峰林场长客分场种源试验林选择的优良单株和广西大学苗圃超级苗繁殖得到的中国马褂木优良无性系进行了无性繁殖性状变异、生理指标及营养元素变异、ISSR指纹图谱建立的研究。研究结果如下：(1)对全州无性系以切接和芽接的方法进行嫁接,切接成活率高于芽接成活率；不同无性系间嫁接成活率差异显著,切接成活率最高的无性系为A19-8和B15-2,成活率高达86.67%,切接成活率最低的无性系为B11-7,成活率仅为26.67%；芽接成活率最高的无性系为B17-3,成活率高达83.33%,芽接成活率最低的无性系为B10-12和B11-6,成活率都仅为9.52%；不同无性系间嫁接苗高生长有显著差异,最高为无性系B10-12,高达43.250cm,最低为无性系A19-8,仅为21.159cm。(2)对林学院苗圃超级苗无性系和高峰无性系进行扦插试验,其中超级苗无性系中生根率最高为无性系F4,最低为无性系M1和Y4；高峰无性系中生根率最高为无性系Y12-4,最低为无性系F12-7、Y8-5、F10-9、G9-5和G8-4；超级苗无性系中各无性系间扦插生根率不存在显著差异；高峰无性系中各无性系间扦插生根率存在极显著差异。(3)对全州无性系和林学院苗圃超级苗无性系进行CAT(过氧化氢酶)、POD(过氧化物酶)、SOD(超氧化物歧化酶)、叶绿素相对含量和可溶性蛋白质含量的测定,全州无性系中CAT、POD、SOD、叶绿素相对含量和可溶性蛋白质含量最高的无性系分别为B17-2、B17-6、B15-2、B14-9和B14-9；超级苗无性系中CAT、POD、SOD、叶绿素相对含量和可溶性蛋白质含量最高的无性系分别为G1、Q5、G1、F4和Y1；两批材料无性系间的CAT、 POD、SOD、叶绿素含量和可溶性蛋白质含量均存在极显著差异。(4)利用10条ISSR引物对53个无性系进行扩增并电泳成图,扩增出条带的多态百分比最高为引物UBC826,该引物扩增出的13条谱带均为多态性谱带,且引物UBC826能区分出的无性系数量最多,单独利用该引物能区分出41个无性系；筛选出最优的最佳引物组合为UBC807和UBC826,利用该引物组合能区分出全部53个无性系,并可以利用该引物组合对53个马褂木无性系进行指纹图谱的建立。