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本研究采用表型性状、孢粉微观特征观察及分子标记法对新疆杏品种的遗传多样性及品种间的亲缘关系展开研究，为新疆杏种质资源更好的被利用保护和种质创新提供依据。主要研究结果如下：
(1)新疆杏品种果实单果重等33个表型指标的遗传多样性相关指数的标准差均值为27.99，变异系数均值为6.13%，香农-威纳指数均值为5.25，辛普森指数均值为0.97；叶面积等指标在品种间的遗传变异程度高，叶片长等指标的遗传变异程度较低，花瓣颜色等指标的遗传多样性较为丰富，叶片长等指标的遗传多样性相对较小。通过聚类分析得出，当遗传距离为5.0时，新疆杏品种间亲缘关系近，其中‘贝新纳尔’和‘英吉沙杏’等品种间的亲缘关系最近；通过主成分分析得出：叶片长等12个主成分因子可以反映表型性状遗传多样性的大部分信息。
(2)通过对新疆杏品种花粉的极轴长等11个微观特征进行分析研究，供试品种在NPC分类中均属于N3P4C5型，其外壁纹饰均属“条纹-穿孔”型，花粉微观形态特征差异较小，相似度极高；供试品种的CV均值为14.88%，香农-威纳指数均值为5.32，辛普森指数均值为0.98，孔径、孔频这2个指标的遗传多样性最丰富。当欧氏距离为15.0时，划分为两组，说明供试品种间总体亲缘关系较近，‘贝新纳尔’和‘英吉沙杏’等品种间亲缘关系最近。
(3)在SRAP分子标记水平上，12条引物共检测出有效基因位点400个，其中多态基因位点有396个，多态性比率到达99%，多态性信息量均值为0.89，引物PCR扩增的多态性较好。在此分子标记中供试品种的有效等位基因均值为1.7015，Neis基因多样性指数的均值为0.4021，香农信息指数均值为0.5882，综合这3项遗传多样性指数，显示新疆杏遗传多样性较丰富。聚类分析中遗传相似系数在0.45-0.92，‘胡安娜’、‘图乃斯坦胡安娜’、‘细黑叶杏’、‘麻木达西杏’这4个品种的亲缘关系最近，遗传相似程度最高，当遗传相似系数在0.51处，供试品种可分为4大类。
(4)在cpSSR分子标记水平上，13条引物共检测出有效基因位点401个，其中多态基因位点有395个，多态性比率为98.5%，多态性信息量均值为0.87，引物PCR扩增的多态性较好。在此分子标记中供试品种的有效等位基因的平均值为1.6978，Neis基因多样性指数的平均值为0.3996，香农信息指数平均值为0.5886，综合这3项遗传多样性指数，显示新疆杏遗传多样性较丰富。聚类分析中品种间的GS在0.51-0.92，当GS在0.51时，41份材料可分为2大类，其中‘克尔基胡安娜’、‘阿克牙格勒克’、‘乔尔胖’‘阿克达拉孜’等8个品种的遗传相似系数最大，均为0.92，这8个品种的亲缘关系最近。
(1)新疆杏品种果实单果重等33个表型指标的遗传多样性相关指数的标准差均值为27.99，变异系数均值为6.13%，香农-威纳指数均值为5.25，辛普森指数均值为0.97；叶面积等指标在品种间的遗传变异程度高，叶片长等指标的遗传变异程度较低，花瓣颜色等指标的遗传多样性较为丰富，叶片长等指标的遗传多样性相对较小。通过聚类分析得出，当遗传距离为5.0时，新疆杏品种间亲缘关系近，其中‘贝新纳尔’和‘英吉沙杏’等品种间的亲缘关系最近；通过主成分分析得出：叶片长等12个主成分因子可以反映表型性状遗传多样性的大部分信息。
(2)通过对新疆杏品种花粉的极轴长等11个微观特征进行分析研究，供试品种在NPC分类中均属于N3P4C5型，其外壁纹饰均属“条纹-穿孔”型，花粉微观形态特征差异较小，相似度极高；供试品种的CV均值为14.88%，香农-威纳指数均值为5.32，辛普森指数均值为0.98，孔径、孔频这2个指标的遗传多样性最丰富。当欧氏距离为15.0时，划分为两组，说明供试品种间总体亲缘关系较近，‘贝新纳尔’和‘英吉沙杏’等品种间亲缘关系最近。
(3)在SRAP分子标记水平上，12条引物共检测出有效基因位点400个，其中多态基因位点有396个，多态性比率到达99%，多态性信息量均值为0.89，引物PCR扩增的多态性较好。在此分子标记中供试品种的有效等位基因均值为1.7015，Neis基因多样性指数的均值为0.4021，香农信息指数均值为0.5882，综合这3项遗传多样性指数，显示新疆杏遗传多样性较丰富。聚类分析中遗传相似系数在0.45-0.92，‘胡安娜’、‘图乃斯坦胡安娜’、‘细黑叶杏’、‘麻木达西杏’这4个品种的亲缘关系最近，遗传相似程度最高，当遗传相似系数在0.51处，供试品种可分为4大类。
(4)在cpSSR分子标记水平上，13条引物共检测出有效基因位点401个，其中多态基因位点有395个，多态性比率为98.5%，多态性信息量均值为0.87，引物PCR扩增的多态性较好。在此分子标记中供试品种的有效等位基因的平均值为1.6978，Neis基因多样性指数的平均值为0.3996，香农信息指数平均值为0.5886，综合这3项遗传多样性指数，显示新疆杏遗传多样性较丰富。聚类分析中品种间的GS在0.51-0.92，当GS在0.51时，41份材料可分为2大类，其中‘克尔基胡安娜’、‘阿克牙格勒克’、‘乔尔胖’‘阿克达拉孜’等8个品种的遗传相似系数最大，均为0.92，这8个品种的亲缘关系最近。