气候变化对草地生态系统有明显的影响,牧草作为草地生态系统的重要组成部分,对气候变化十分敏感。短花针茅(Stipa brevifloa)是荒漠草原区优质牧草,也是我国草原区面积分布较为广阔的针茅属植物之一。研究增温施氮下短花针茅花期相关基因的表达差异对揭示气候变化下短花针茅的分子响应机制有重要意义。本研究以野外人工控制增温、施氮处理下的短花针茅为材料,在不同花期对其生殖枝进行了转录组测序,筛选并分析出与花期相关的差异表达基因,同时对这些基因进行了表达模式的分析,主要研究结果如下:1.测序共产生4.39G的高质量数据,91.5Mb的clean reads及126583个Unigene序列,序列总长94542261bp,平均长度747bp,N50长度789bp。2.Blast同源比对共有77584个Unigene与已知的基因匹配成功,其中有67279个Unigene注释到NR数据库中;52991个Unigene可归划于56个GO功能条目中;27436个Unigene归划于25个COG蛋白族中;26585个Unigene注释到KEGG代谢途径中。有48999个Unigene没有匹配序列,其中多数为短花针茅中特有的基因。3.差异代谢通路富集及差异基因RPKM分析得出植物-昼夜节律途径上13个差异表达基因(PRR7-1、PRR7-2、COP1-1、COP1-2、FT-1、FT-2、HY5-1、HY5-2、CH5-2、CHS-3、LHY、PHY4、ELF3)均与植物花期发育相关,经过RT-qPCR验证分析,其表达趋势均与测序结果一致。4.增温下FT-2、PRR7-2基因高表达,可能由于短花针茅生殖枝在增温下提前进入枯黄期有关;PRR7-1、LHY、ELF3基因在施氮处理下开花前期至中期表达下调,可能与施氮处理下花期延后有关;PRR7-1、PRR7-2、COP1-1、LHY在增温施氮交互作用下表达也发生较大的变化,可能在短花针茅花期的中后期促进花期相关基因的表达。