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目的：对比研究超声引导下经皮微波消融（Percutaneous Microwave Coagulation Therapy，PMCT）与腹腔镜肝切除术（Lparoscopic Hepatectomy,LH)、开腹肝切除术（Open Hepatectomy,OH）治疗直径≤3cm的原发性肝癌的疗效。 方法：回顾性分析2009年2月至2017年5月在我院接受治疗的406例单发原发性小肝癌患者的资料，其中PMCT组140例，LH组116例，OH组150例，比较三组不同治疗方式的短期及长期疗效，分析影响原发性小肝癌的预后因素。 结果：对于原发性小肝癌患者，PMCT组1、3、5年总生存率及无瘤生存率与LH组、OH组相似（P=0.194，P=0.225）。对于大血管旁部位的原发性小肝癌患者，PMCT组1、3、5年总生存率及无瘤生存率与LH组、OH组相似（P=0.499，P=0.727）。对于特殊部位的原发性小肝癌患者，PMCT组1、3、5年总生存率及无瘤生存率低于LH组及OH组（P=0.018，P=0.003）,LH组总生存率及无瘤生存率与OH组相似（P=0.574，P=0.152）。PMCT组140例患者治疗后肝功能(ALT)、并发症发生率、治疗时间、治疗中出血量、治疗后体温、治疗后住院天数、住院费用均明显优于LH组及OH组（P＜0.05）。三组首次完全消除率比较，LH组、OH组优于PMCT组（P=0.003），LH组与OH组一致（P=1.00）。LH组复发率低于PMCT组（P=0.005），而PMCT组复发率与OH组相似（P=0.158），LH组复发率与OH组相似（P=0.124）。单因素及多因素结果显示年龄（＞60岁）、术前高总胆红素、有肝外转移是影响原发性小肝癌预后的独立危险因素，而治疗方式不同不是影响原发性小肝癌预后的因素。 结论：超声引导下PMCT治疗原发性小肝癌安全微创、经济可靠，与LH及OH取得了相似的短期及长期疗效。对于特殊部位的原发性小肝癌患者，LH或OH是更好的治疗方法。对于大血管旁部位的原发性小肝癌患者，超声引导下PMCT对机体损伤小、治疗后恢复快，并且取得了与LH及OH一致的疗效，可作为首选治疗方法。