青岛文昌鱼AmphiS23基因和AmphiL35基因的克隆及进化分析

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本文从青岛文昌鱼(Branchiostoma belcheri tsingtauense)消化道cDNA文库中得到两个cDNA克隆,鉴定后确定它们分别编码文昌鱼核糖体蛋白S23和L35的基因,命名为AmphiS23和AmphiL35。AmphiS23 cDNA全长为546bp,由一个26bp的5’非转译区(UTR)、一个432bp的开放阅读框(ORF)和一个88bp的3’UTR组成;开放阅读框编码一个143个氨基酸组成的蛋白,分子量为15,851 Da,等电点(pI)为10.706。AmphiL35 cDNA全长473bp,由一个27bp的5’UTR、一个372bp的开放阅读框和一个74bp的3’UTR组成;开放阅读框编码一个123个氨基酸组成的蛋白,分子量为14,543 Da,pI为10.809。AmphiL35碱性氨基酸和酸性氨基酸的比例为4:1,与其他动物核糖体蛋白L35类似。 AmphiS23和AmphiL35分别与其他真核生物的S23与L35核糖体蛋白序列比较后显示,AmphiS23与脊椎动物的S23蛋白同源性大于83%,与非脊椎动物S23蛋白同源性大于84%;AmphiL35与脊椎动物的L35蛋白同源性大于63%,与非脊椎动物L35蛋白相似性大于52%,S23和L35氨基酸序列的显著相似性证明了它们在漫长的进化过程中是相当保守的。 本文还采用DIG标记AmphiS23和AmphiL35的cDNA,与限制性内切酶消化后的文昌鱼基因组DNA进行Southern杂交。结果表明,青岛文昌鱼基因组中S23基因的拷贝数为1-2个,L35基因拷贝数为2-3个。与之形成鲜明对比的是大鼠基因组中S23基因和L35基因拷贝数分别为6-13个和15-17个。由此可推测,持家基因S23及L35在脊椎动物的进化过程中如同奢侈基因一样,也发生了倍增。
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