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鲤鱼(Cyprinus carpio L.)是我国重要的淡水经济鱼类，由于其含有较高的营养成分，且具有一定的药用价值，因而倍受人们喜爱。但是随着养殖密度的增高，而水体中含有较多且复杂的微生物群，鲤鱼中会常出现由病毒或细菌引起的疾病，成为生产中面临的主要问题之一。鲤鱼作为一种低等的脊椎动物，与哺乳动物相比，特异性免疫系统还不够发达，因此主要依靠天然免疫系统抵抗外来入侵的病原微生物。天然免疫系统是机体防御病原微生物入侵的首道防线，机体通过模式识别受体（PRRs）来识别包括TLRs、NLRs和RLRs在内的病原相关分子模式（PAMPs），诱导干扰素及促炎症细胞因子的表达。RLR家族是2004年新发现的一类PRR，有三个成员，包括RIG-I、MDA5和LGP2。RIG-I和MDA5的CARD结构域与IPS-1的CARD结构域相结合，从而激活其下游信号分子，启动IRF37和NF-κB信号通路。LGP则作为正调控因子参与RLR抗病毒信号通路。本研究通过设计引物，利用半定量RT-PCR和RACE技术克隆了鲤鱼MDA5和LGP2，并运用生物信息学分析其蛋白结构及进化关系，使用Real-time PCR检测分析正常鲤鱼及经过poly I:C注射刺激的鲤鱼各个组织中MDA5和LGP2mRNA表达量变化，研究其在鲤鱼抗病毒天然免疫过程中发挥的作用。鲤鱼MDA5cDNA全长3851bp，编码993个氨基酸。预测鲤鱼MDA5氨基酸序列包含六个结构域：1个CARD、1个DExDc、1个ResIII、2个HELICc和1个RD。鲤鱼MDA5mRNA在被测组织中均有表达，在鳃和脾脏中表达量最高，其次是皮肤、脑、肌肉和后肠，而在性腺和血液中的表达量较低。与注射PBS的对照相比，经poly I:C注射刺激的鲤鱼各个组织中MDA5mRNA的表达量明显升高。肝脏中MDA5在3h就有明显上升，注射后6h达到最高值（86.3倍，P﹤0.05），1d又恢复到原来水平；脾脏中MDA5在6h达到最高值（18.8倍，P﹤0.05），且一直维持到12h，1d开始有明显降低，注射后2d恢复到正常水平；头肾中3h有明显升高，6h达到最高值（24.1倍， P﹤0.05），注射后3d其mRNA表达量才恢复到原来水平；在皮肤和鳃中，MDA5表达量都是在6小时达到峰值（26.8倍和139.3倍，P﹤0.05），注射后2d恢复到正常水平；前肠和后肠中，MDA5在3h表达量显著上升，前肠升高500.2倍，后肠升高15.0倍，注射后6h表达量开始有明显降低（P﹤0.05）。LGP2cDNA全长2978bp，编码679个氨基酸。预测鲤鱼LGP2氨基酸序列包含五个结构域：2个DExDc、1个ResIII、1个HELICc和1个RD。LGP2mRNA在被测组织中均有广泛的表达，在鳃、脑和脾中表达量最高，在口腔上皮、性腺和血液中的表达量最低。与注射PBS的对照相比，经poly I:C注射刺激的鲤鱼各个组织中LGP2mRNA的表达量明显升高。LGP2在肝脏中3h达到最高值（175.3倍，P﹤0.05），注射后2d恢复到正常水平；脾脏中，注射3h就有明显上升，12h达到峰值（55.5倍，P﹤0.05），注射后3d恢复到正常水平；头肾中LGP2表达量3h开始有显著上升，6h达到峰值（77.2倍，P﹤0.05），12h有所下降，1d恢复到正常水平；皮肤中6h达到峰值（54.6倍，P﹤0.05），注射后3d恢复到正常水平；鳃中LGP2表达量在12h达到峰值（57.5倍，P﹤0.05）1d突然降低；前肠和后肠中，LGP2mRNA表达量都是在3h达到峰值（224.6倍和11.5倍，P﹤0.05），注射后6h表达量开始有明显降低。以上结果显示，MDA5和LGP2参与鲤鱼抗病毒天然免疫过程，为研究硬骨鱼类天然免疫机制提供了重要理论依据。