【摘 要】
：
随着人类基因组计划的完成,生物序列数据与日俱增,分析和处理海量的生物数据,从中提取对人类有价值的信息.这些工作成为生物信息学首要的研究内容.本文的工作主要是:通过对数
论文部分内容阅读
随着人类基因组计划的完成,生物序列数据与日俱增,分析和处理海量的生物数据,从中提取对人类有价值的信息.这些工作成为生物信息学首要的研究内容.本文的工作主要是:通过对数关联距离和互信息距离来分析30种细小病毒和124种dsDNA病毒的系统发育关系. 本文主要分四个部分组成.第一部分,主要介绍生物信息学的概念、生物信息学的研究对象和研究内容.同时介绍了生物信息学中常用的数学方法和模型以及病毒的相关基本知识. 第二部分,基于统计和信息论两个方面,提出了两种距离(对数关联距离和互信息距离).另外,还简要地解释了这两种距离用于物种系统发育分析的原因. 第三部分,利用提出的两种新距离分别处理和分析30种细小病毒和124种dsDNA病毒的完全基因组序列,分别构建它们的系统发育树.在30种细小病毒和124种dsDNA病毒的系统发育分析中,获得了与传统的系统发生树相一致的树,综合以前的分析和结果,在系统发育分析研究中提出的算法和模型是可靠的、稳定的.同时,从生物学的角度出发,讨论了系统发生树分类的情况. 第四部分,是对整篇文章的总结,对所运用的理论和方法进行归纳.同时对需要进一步开展的工作,同时也做了简要的说明.
其他文献
本文第一部分以常系数线性标量延迟微分方程(DDEs)为模型,证明了隐式中点法和梯形法都是B一稳定且条件收缩的,并以一类变系数半线性标量Volterra泛函微分方程为模型,进一步证
有限体积元方法作为偏微分方程的离散方法,首先将计算区域进行网格剖分和对偶网格剖分,其中对偶网格单元称为控制体积;其次,在控制体积上对微分方程进行积分,导出微分方程的
本文分为两个部分,在第一部分,就一类三阶奇异摄动方程组的求解提出了一种有效的求解方法,先利用线性方程的叠加原理和极值原理将三阶奇异摄动方程组近似的分解为一个二阶奇
泛函微分方程(FDEs)在生物学、物理学、化学、经济学、控制理论等众多领域有广泛应用。由于其理论解很难获得,只能用数值方法进行近似计算,因而其算法理论的研究具有毋庸置疑
时滞是客观世界及工程实际中普遍存在的现象。时滞的存在会严重降低系统的性能,在某些情况下,还可能导致系统不稳定。奇异系统是一类形式更一般化,并有着广泛应用背景的动力
随着科技的进步，纠错码理论的可实现化，纠错码技术得到了极为广泛的应用，如应用于数字通信系统及计算机存储和运算系统中，超大规模集成电路设计中，甚至在神经元网络中也采用了纠错
自适应有限元方法自上世纪七十年代以来一直都是科学与工程计算领域的研究热点,是一种以常规有限元方法为基础通过后验误差估计和网格自动调整来不断提高逼近解精度的数值计
在跳跃线性(线性二次)控制系统中,最优控制是问题之一.然而现实生活中的控制问题往往都很复杂,人们发现用正面、直接地方法去解决这些问题十分困难,而是在条件允许的范围内进
图G的(d,1)-全标号是对顶点和边的一个整数分配,使得图G中任意两个相邻的顶点得到不同的标号,任意两条相邻的边得到不同的标号,任意顶点和与它相关联的边得到的标号差的绝对