农业上市公司是我国现阶段先进生产力的企业组织，一头连接市场，一头连接农产品的生产与供给，研究农业上市公司资本结构的问题，不仅可以丰富发展资本结构理论，同时对目前我国农业上市公司产业结构的调整、融资行为的规范、治理结构的优化和农业产业的进一步发展都有着重要的意义。本文以农业上市公司为研究对象，首先，对西方资本结构理论进行了梳理和回顾，从而对资本结构理论有了比较充分的认识。然后，收集并整理在上海和深圳两证券交易所上市的农业上市公司的各项数据资料，利用描述性统计分析并制作成图表，直观地反映出了目前我国农业上市公司数量偏少、规模偏小、行业分布广泛、区域分布不均、经营业绩不佳和弃农现象严重的基本情况，同时反映了资本结构中存在的资产负债率水平较低、融资结构失衡，内源融资比例偏小、债务结构不合理，长期负债比例偏低和股权集中程度较高等问题。接下来，从宏观和微观两方面对影响农业上市公司资本结构的因素进行了理论分析。下一步，筛选出符合要求的农业上市公司，选取具有代表性的、对资本结构可能产生影响的微观因素，包括公司规模、盈利能力、企业成长性、非债务税盾、资产担保价值、资产结构、股权结构、偿债能力和所得税率等9类共17个指标，利用SPSS软件，通过主成分分析法和多元线性回归法，得出了各指标对农业上市公司资本结构影响的显著情况，结果显示：盈利能力因子与资产负债率和流动资产负债率呈负相关，且效果显著，即盈利能力强的公司倾向于低负债；偿债能力因子与资产负债率和流动资产负债率呈负相关关系，且效果显著，这表明偿债能力越强的公司其负债率越低；税盾因子与资产负债率和流动资产负债率呈负相关，即企业拥有的非负债税盾越多，负债率就越低；规模因子与资产负债率和流动资产负债率存在正相关关系；股权结构因子与资产负债率和流动资产负债率呈负相关，即流通股比重越高，第一股东持股比例越高，企业的负债率就越低；所得税率因子与资产负债率和流动资产负债率的关系均不显著；长期资产负债率未能通过回归方程的显著性检验，即所有变量均不能解释长期资产负债率的大小。最后，针对我国农业上市公司资本结构现状、存在问题以及影响因素的理论与实证分析，从优化债务期限结构、发展企业债券市场、提高公司的盈利水平、扩大流通股比例，保护中小股东权益等四个方面提出了优化资本结构的对策。