社会主义市场经济条件下,实行分税制的同时,税务机构如何设置一直是理论界讨论的话题。国税局与地税局的分设曾发挥过积极的历史作用。分设之初,保证了分税制财税体制改革的顺利实施,保证了中央税收收入的安全,增强了中央财政宏观调控的能力,调动了中央和地方的两个积极性；随着我国社会主义市场经济的进一步发展,目前也凸现出了一些弊端,增加了纳税人的负担,增加了税收成本忽视了效率,在某些方面增加了征税的难度,而且出现了国家税务局与地方税务局执法不统一的情况。因此,应当将国家税务局与地方税务局合并。税务机构的合并有利于依法治税,有利于减轻纳税人的负担,有利于提高征管效率,有利于我国税收制度的发展完善和税务组织的管理,符合我国行政管理体制改革的目标。国家税务局税、地方税务局的功能、职责、职能几乎完全相同,都是既为中央又为地方组织税收收入,完全没有分设两套税务机构的必要,这些都为税务机构的合并提供了可能性。合并我国现行税务机构应当坚持循序渐进、完整统一和职责分明三大原则。在具体的合并过程中,首先应将地方税务局由省及以下垂直管理变成由国家税务总局垂直管理,然后进行国税局与地税局的合并,其次合理设置层级税务机构,在省、市、县一级相应设立税务机构,并合理划分各级税务机构的职责。