汉族儿童哮喘易感基因预测模型的优化和验证

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:LAP281482184
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第一部分汉族儿童哮喘易感基因预测模型的优化目的扩大样本含量,对我们前期建立的汉族儿童哮喘易感基因预测模型(由IL13-1112C>T、IL13+1923C>T、IL13 R110Q、IL4-590C>T、ADRB2 R16G、FCER1B-109C>T、FCER1B E237G、IL4RA I75V和IL4RA Q551R构成)进行优化。方法在1000名汉族哮喘儿童组和1000名正常对照组中,对上述5个基因的9个单核苷酸多态性位点进行基因分型,采用多因子降维法进行基因交互作用分析。结果IL13 R110Q、IL4-590C>T、ADRB2 R16G和FCER1B E237G这4个多态性位点构成最佳哮喘易感基因模型(检验样本准确度=0.6089,交叉验证一致性=10/10,P=6.98E-05)。上述4个位点每个均分别与儿童哮喘发病相关(IL13 R110Q位点G等位基因,OR=1.24,P=1.23E-03;IL4-590C>T位点T等位基因,OR=1.25,P=3.81E-03;ADRB2 R16G位点A等位基因,OR=1.29,P=6.75E-05;FCER1B E237G位点G等位基因,OR=1.27,P=3.86E-03)。4个位点均为风险等位基因纯合子者(IL13 R110Q GG+IL4-590C>T TT+ADRB2 R16G AA+FCER1B E237G GG)患哮喘的危险度显著高于不携带任何风险等位基因纯合子者(P=4.28E-03,OR=13.55),也明显高于仅携带1、2或3个风险等位基因纯合子者(P=6.51E-03,OR=10.09)。结论IL13 R110Q、IL4-590C>T、ADRB2 R16G和FCER1B E237G构成优化后的汉族儿童哮喘易感基因预测模型,四个位点分别与儿童哮喘发病相关,且具有显著的协同作用,共同提高哮喘发病危险度。第二部分优化的汉族儿童哮喘易感基因预测模型在出生队列中的验证目的在出生队列中验证优化的汉族儿童哮喘易感基因预测模型(由IIL13 R110Q、IL4-590C>T、ADRB2 R16G和FCER1B E237G构成)。方法应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱方法对出生队列中711名新生儿进行上述4位点基因分型,根据汉族儿童哮喘易感基因预测模型将其分为哮喘高危组和低危组。采用ImmunoCAP Total Low Range方法进行脐带血清总IgE浓度检测。通过问卷调查方式随访儿童生后2年内过敏性疾病发生情况。比较哮喘高危组和低危组在脐血总IgE水平及过敏性疾病患病率方面的差异。结果哮喘高危组334人,低危组377人。两组脐血总IgE水平升高者各占31.08%、24.33%,前者高于后者(OR(95%CI)=1.40(1.01-1.96),P=4.63E-02)。哮喘高危组32.28%患有湿疹,而低危组24.60%出现湿疹,前者明显高于后者(RR(95%CI)=1.31(1.02-1.70),P=3.72E-02);两组在食物过敏、喘息和鼻炎方面差异无统计学意义(P>0.05)。哮喘高危组具有上述过敏性疾病或症状者达43.51%,显著高于哮喘低危组的35.14%(RR(95%CI)=1.24(1.01-1.51),P=3.63E-02)。结论哮喘高危组脐血总IgE水平及过敏性疾病患病率高于低危组。汉族儿童哮喘易感基因预测模型还需要在出生队列中进行更长时间的随访验证,以明确其对哮喘的预测价值。第三部分优化的汉族儿童哮喘易感基因预测模型在喘息儿童中的验证目的在喘息儿童中验证优化的汉族儿童哮喘易感基因预测模型(由IIL13 R110Q、IL4-590C>T、ADRB2 R16G和FCER1B E237G构成)。方法应用TaqMan实时荧光定量聚合酶链式反应方法对212名喘息儿童进行上述4位点基因分型,根据汉族儿童哮喘易感基因预测模型将其分为哮喘高危组和低危组。分别采用宽松、严格哮喘预测指数对所有喘息儿童进行阳性或阴性判定。比较哮喘高危组和低危组在哮喘预测指数阳性所占比方面的差异。结果哮喘高危组95人,低危组117人,两组在性别、年龄上无统计学差异(P>0.05)。哮喘高、低危组中,宽松哮喘预测指数阳性者分别为85、61人,各占89.47%、52.14%,前者高于后者(OR(95%CI)=7.80(3.69-16.50),P=5.26E-09);严格哮喘预测指数阳性者分别为71、21人,各占74.74%、17.95%,前者也显著高于后者(OR(95%CI)=13.52(6.98-26.20),P=1.07E-16)。结论哮喘高危组较低危组更多喘息儿童哮喘预测指数阳性,基因模型与哮喘预测指数具有强相关性。汉族儿童哮喘易感基因预测模型需要在喘息儿童中进行长期随访验证,以明确其对哮喘的预测价值。
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