室内空气微生物污染状况因对人体有重要影响而受到研究人员和居民的普遍关注。目前的研究还缺乏对生物气溶胶的健康效应和影响因素的研究。探究生物气溶胶对人体的健康效应和影响因素可以为相关的控制规程提供数据和相应的预防措施。本研究选取了南京市的28所住宅,4所学校,2座办公楼和一所医院作为研究对象,测量了其冬夏两季空气中细菌和真菌的浓度和群落结构。本研究采用安德森采样器和培养法测量了可培养细菌和真菌的浓度和粒径分布,并根据培养结果计算了不同建筑中人群的微生物摄入量和非致癌风险。同时通过测序法研究了细菌和真菌的种群结构和致病菌,计算了军团菌和金黄色葡萄球菌的疾病负担。最后研究了室外生物气溶胶和环境参数对室内生物气溶胶的影响以及不同微生物相互之间的影响。共计222所房间,1029个可培养微生物样本,203个测序样本参与到本研究中。结果表明,室内可培养生物气溶胶在夏季（细菌631.8CFU/m~3,真菌541.5 CFU/m~3）的平均水平高于冬季（细菌203.8CFU/m~3,真菌352.5 CFU/m~3）。四种类型的建筑比较中,细菌在医院达到峰值,而真菌在住宅中平均浓度最高。四种建筑中的微生物粒径分布差异较小,生物气溶胶粒径在1.1–2.1μm的范围内达到峰值。风险评估显示医院中细菌和真菌的非致癌风险最高。可培养微生物浓度与疾病之间的关联（odds ratio）接近1,即其浓度的上升与患病率增减无显著关系。此外,室内空气中检测到了一系列的致病菌（如洛非不动杆菌Acinetobacter lwoffii,白色念珠菌Candida albicans,肺炎链球菌Streptococcus pneumoniae,和黄曲霉菌Aspergillus flavus）这会威胁免疫力不足的室内人员的健康。根据室内致病菌检测和感染率模型建立了金黄色葡萄球菌和军团菌的疾病负担计算模型,比较了不同浓度下导致的伤残调整寿命年,为其他致病菌的疾病负担计算提供了方法。此外,有72.12%的房间的可培养细菌的室内外比值I/O比大于1,而74.34%的被调查房间中可培养真菌的I/O比低于1。相关性分析表明,可培养生物气溶胶含量与环境参数（温度,相对湿度,CO2浓度）呈正相关。本研究的结果可以为微生物标准提供参考依据。本研究说明了同时关注空气微生物浓度,粒径和种类的重要性,尤其是致病菌种类。风险评估、致病菌检测和影响因素分析说明医院内的人员有比其他建筑内人员更高的暴露风险,所以应该采取更多措施来保障人员健康,比如通风。