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油茶(Camellia oleifera Abel.)是指山茶科(Theaceae)山茶属(CamelliaL.)油脂含量较高且有栽培经济价值的一类植物的总称。本研究从湖北省的东南西北四个区域的不同地区采集了无病虫害且生长旺盛的优良单株新鲜叶片,进行ISSR遗传多样性分析。同时针对25个表现良好的单株果实进行脂肪酸分析,为下一步选优工作提供理论依据。主要结果如下：(1)从99条ISSR引物中筛选出16条多态性带数且谱带亮度等方面均表现良好的引物,用这16条引物对110个油茶叶样的基因组DNA进行PCR扩增,共得到221条扩增谱带,其中多态性条带218条,多态性百分率(PPB)达到99.09%。(2)分别采用多态位点百分率(PPB)、有效等位基因指数(AE)、观测等位基因指数(A0)、Ne’基因多样性指数(HE)以及Shannon’s多态信息指数来衡量油茶的遗传多样性,结果表明,湖北省不同产地间的油茶的遗传多样性水平较高：湖北省油茶的物种水平遗传多样性达到99.09%,群体多态位点百分比达到了61.49%,Nei’s遗传多样性指数为0.2776,Shannon’s多态信息指数为0.4291。(3)七个主要县市的遗传多样性比较：松滋地区的各项指标均为最高,五峰地区的多态性百分率和观测等位基因(AO)指数为最低,武汉狮子山的有效等位基因指数(AE)、Nei’s基因多样性指数和Shannon’s信息指数均为最低。松滋地区的多态性百分率为85.45%,观测等位基因指数(AO)为1.8545,有效等位基因指数(AE)为1.3852,Nei’s基因多样性指数为0.2423,Shannon’s信息指数为0.3795。五峰地区的多态性百分率为52.73%,观测等位基因(AO)指数为1.5273。武汉狮子山的有效等位基因指数(AE)为1.2539、Nei’s基因多样性为0.157和Shannon’s信息指数为0.2438。(4)根据群体间的Nei’s遗传一致度(I)和Nei’s遗传距离(D),应用NTSYS2.1软件,采用UPGMA法构建聚类图,结果发现：麻城、阳新、新洲、五峰、谷城和武汉六个地区的个体基本上可以聚集在一起,而松滋地区的不同个体不能按地区聚集在一起间,遗传距离相差很大,这可能是因为其资源是由不同地方引进的原因导致的。(5)油茶的主要经济性状与鲜籽含油率相关性大小为：干仁含油率>鲜籽出仁率>种仁含水率>冠幅单面积产量>单株产量>冠幅。其中与之呈显著正相关的是鲜籽出仁率和干仁含油率,相关系数分别为0.622、0.928。其他指标虽然与之呈负相关,但不显著。(6)油茶的鲜籽含油率为14.84%～36.41%,表明地区间有较大的差异。(7)油茶脂肪酸的成分主要是油酸、亚油酸、棕榈酸和硬脂酸,不同采样地点的单株脂肪酸组成有一定的差异。其中不饱和脂肪酸总量范围为76.30%～91.04%,平均含量为88.86%,变动系数为3.51%；油酸含量范围为65.70%～84.48%,平均含量为79.85%,变动系数为5.14%；亚油酸含量范围为6.14%～13.37%,平均含量为9.63%,变动系数为23.01%；棕榈酸含量范围为6.61%～11.01%,平均含量为7.97%,变动系数为11.88%。(8)油茶种子各脂肪酸组成成分的含量之间存在显著相关性,其中油酸与亚油酸含量存在极显著负相关,相关系数-0.631,而二者含量之和相对稳定。