FXR1P相关miRNA的筛选及miR-323a-3p靶标的验证

来源 :南华大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:dusl520
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
脆性X综合征(Fragile X syndrome,FXS)是一种常见的遗传性智力低下疾病,其致病相关基因----脆性X智力低下基因1(Fragile X mental retardation gene1,FMR1)、脆性X相关基因-1(Fragile X-related gene1, FXR1)和脆性X相关基因-2(Fragile X-related gene2, FXR2)构成了脆性X基因家族。这三个基因各自对应的编码蛋白脆性X智力低下蛋白(Fragile X mental retardation protein, FMRP)、脆性X相关蛋白1(Fragile X related protein1,FXR1P)和脆性X相关蛋白2(Fragile Xrelated protein2, FXR2P)则组成了脆性X蛋白家族。由于该蛋白家族成员在结构上均具有精氨酸甘氨酸簇(RGG box, RGG盒)和核蛋白K同源结构域(KH结构域)等RNA结合结构域,因而它们均属于RNA结合蛋白(RNAbinding protein, RBP)。microRNA (miRNA)是一类大小约18~25nt的小分子非编码RNA,可通过与靶mRNA3’UTR特异性结合来介导翻译,产生特定的生物学效应。对于FXR1P与miRNA及其靶mRNA之间相互作用的研究,有利于从RNA水平上明确FXR1P在FXS中可能的调节和致病机制。目的:1、筛选与FXR1P相关的miRNA。2、验证筛选得到的miRNA与预测靶mRNA之间的关系。方法:1、在人神经母细胞瘤细胞(SH-SY5Y)中采用RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA-binding protein immunoprecipitation, RIP)技术捕获与FXR1P结合的miRNA,对其进行加头、加尾、逆转录、PCR扩增和连接转化等处理后,获得与FXR1P相关的miRNA。2、运用生物信息学数据库TargetScanHuman、microRNA和miRWalk预测筛选miRNA可能作用的靶标。3、构建含靶mRNA3’UTR的双荧光素酶报告基因载体psiCheck-2-mRNA3’UTR,并通过酶切和测序加以验证。4、将构建成功的重组载体psiCheck-2-mRNA3’UTR与人工合成的miRNA mimics共转染人胚肾上皮细胞(Human embryonic kidney epithelial cell,293T细胞)后,检测报告基因的相对荧光素酶活性,以明确miRNA与预测靶标之间的对应关系。结果:1、筛选获得3个与FXR1P相关的miRNA:miR-323a-3p、miR-19b-3p和miR-1252-5p。2、利用生物信息学数据库预测确定胞嘧啶单核苷酸-N-乙酰神经氨酸合成酶(Cytidine monophosphate-N-acetylneuraminic acid synthetase, CMAS)为miR-323a-3p的候选靶标。3、酶切和测序结果显示成功构建了双荧光素酶报告基因重组载体psiCheck-2-CMAS3’UTR。4、共转重组载体psiCheck-2-CMAS3’UTR和miRNA-323a-3p mimics至293T细胞后,miR-323-3p过表达组的荧光素酶活性显著低于阴性对照组(P<0.05)。结论:1、筛选获得3个与FXR1P相关的miRNA:miR-323a-3p、miR-19b-3p和miR-1252-5p。2、CMAS是miR-323a-3p的靶基因。
其他文献
摘 要: 没有兴趣的学习无异是一种苦役。兴趣是学习的最佳营养剂和催化剂,学生对学习有了兴趣,学习就能取得事半功倍的效果。要调动学生思维的积极性,发挥学生学习的主动性,就必须培养学生的学习兴趣。在中学数学教学中,教师通过“造幽默”、“打比喻”、“讲故事”、“创设情境”等多种形式的教学情境的“巧设”,可以将教学内容化抽象为具体,让数学课堂焕发新的生机。  关键词: 中学数学教学 数学学习兴
微机械加速度传感器由于体积小、成本低、功耗低等优点被广泛应用于各种惯性导航系统以及振动检测系统当中。依据当前微机械加速度传感器的零偏性能与标定问题,本文设计一套
郁金香是世界著名的球根花卉,在中国各地已经被广泛引种栽培.郁金香发生退化一直是种植过程中普遍遇到的一个问题,为此,我们分别对常规栽植郁金香和促成栽培郁金香的退化指标
摘 要: 在教育领域有效应用现代的信息技术,改变了传统的教学手段甚至是教育理念。在本文中,作者就在高中数学课堂教学中有效应用信息技术以提高课堂效率这一课题进行分析探讨。  关键词: 信息技术 高中数学课堂教学 教学效率  “计算机无处不在”与“数学无处不在”是21世纪的两个重要的特征。当下,信息技术快速发展的同时也对现有的教学模式产生了重要的影响。在开好信息技术课程的同时,应努力
摘 要: 有效教学是教师的社会价值和个人价值的共同体现,表现为教学目标的实现和学生综合素质的发展。目前,在高中数学教学中还存在着与新课程标准不相适应的教学计划和教学方法,主要表现在把学生当做教育的客体,视他们为接受知识的容器,忽视了学生学习的自主性和终身学习能力的培养;教学是学生和老师之间的一种特殊的精神交往,如果师生之间缺乏互动和感情交流,就会造成无效教学或者低效教学。本文对数学有效教学的
目的 观察脑缺血期间脑血流量(CBF)、生化代谢的变化与缺血脑组织损伤程度的关系,来研究脑缺血损伤机制及人参皂苷Rg_2的作用。方法 采用显微外科技术,电凝闭经眶暴露的猫左侧MCA起始部,建立局灶性脑缺血模型。在缺血前及缺血期间用MFV-1200型电磁流量计测量CBF,MPA2000多道生物信号采样分析系统监控心电、平均动脉压(MABP)。6小时后取左侧半脑的新鲜脑片行TTC染色估测梗死面积。
本研究主要采用常规血管注射法,常规石蜡切片法,以及光学显微照相系统和荧光显微数码照相系统对中国大鲵(Andrias Davidianus)的循环系统进行了比较详细的解剖学观察研究,并
摘 要: 数学教学关键是教会学生如何运用所学的知识解决问题,即要提高学生的解题能力。文章从重视学生数学思想方法的渗透,重视例题的规范作用,重视符合学生思路的问题解决,重视学生非智力因素培养学生良好的思维品质四个方面谈如何培养学生的解题能力。  关键词: 高中数学教学 解题能力 培养方法  “问题”是数学的心脏,美国数学家哈尔莫斯认为:“数学的真正的组成部分是问题和解,掌握数学就是
摘 要: 数学活动具有内隐性、数学化、层次性、平等性等性质。有效的数学活动教学要求重视数学的“再创造”。基于学生已有的知识和经验,加大数学活动的探索性成分,引导学生“数学地思维”和“做数学”。  关键词: 有效教学 数学活动教学 教学质量  前苏联数学教育家斯托利亚尔曾提出“数学教学应该是数学活动的教学”的观点。数学活动是指把数学教学的积极性概念作为一定结构的思维活动的形式和发展