国家农业科技成果转化资金是经国务院批准设立,为加速农业科技成果转化,引导和推动农业科技成果尽快转化为现实生产力,为新阶段我国农业和农村经济发展提供强有力的科技支撑的政府专项资金。项目在促进科技要素向农村流动、加速农业产业结构调整和升级、带动社会资金加大科技成果转化投入等方面取得了一定的成效。但项目实施中也存在农业科技成果转化资金使用不合理、缺乏有效的科技转化平台等问题。本文围绕近年来新疆维吾尔自治区国家农业科技成果转化资金项目在所属农业技术领域、资金使用特点及科技成果转化模式的变化等内容,根据项目执行的情况设置执行绩效评价体系,对项目执行期内取得的绩效进行总结分析,本文以新疆维吾尔自治区为例进行实例分析,选取了2012-2014年参与中期评估的40个项目为样本进行综合分析,发现项目实施中存在的问题。并结合存在问题从政府管理的角度提出相应的对策建议。