目前,开发海洋己成为世界科技革命重要的领域,海洋药物作为海洋经济中重要的组成部分与海洋生物资源利用的前沿,近年来受到了各级政府越来越多的重视,海洋药物产业现在面临极好的发展机遇。海洋药物集群在推进产学研合作、加快科技成果成功产业化发挥了重要作用,为我国创制新药,赶超世界水平提供了新的途径。但是,作为知识密集型高科技产业集群,我国的海洋药物自主创新能力相对较弱,虽然集群成员在地理上接近,但没有在成员之间形成较强技术关联与协作创新,技术辐射与创新带动作用对地方经济也不明显,集群创新效应没有体现。作为一种知识密集型高科技集群,集群自主创新,实质上就是集群中不同知识的重新组合与聚化,可以依靠集群知识管理,研究集群知识转化与产生过程,利用适当的知识交流途径,促进集群知识生成更高层次的知识,完成集群知识升华,加强集群自主创新能力,提高集群竞争优势。本文综合运用产业集群理论、集群创新理论、知识管理及社会网络等相关理论研究基础上,借鉴学者已有的研究成果,应用复杂系统论、博弈论来分析海洋药物集群自主创新与知识升华相关问题。首先,从海洋药物集群知识密集型特点,对已有的组织知识转化模型进行分析,结合相关生化理论与仿生学并以知识流动视角总结概括出集群知识升华的模型,分析了集群知识流动的途径及知识升华的过程;其次,根据集群竞争优势理论,确立了从集群知识溢出、知识流动、集群学习、集群协作竞争维度分析了影响集群创新的因素,并构建了与集群创新相关的数学模型、关系模型与网络模型。最后,针对知识在集群中的传播途径,提出了利用社会网络方法对集群节点进行分,对集群内部成员之间由于知识交流所形成的网络的整体特征与个体特征进行分析,探究集群中存在的核心节点以及阻碍集群内部知识流动及共享的问题节点,对如何促进集群知识流动及创新的制度及措施提出了一定措施。并对海洋药物集群自主创新与知识升华进行分析与展望,提出了促进集群自主创新与知识升华的对策和建议。通过研究,本文获得了以下研究成果与结论:(1)结合知识密集型海洋药物集群特点,运用知识转化理论、集群创新理论与复杂系统理论等,并应用仿生学(人类进食)与生化理论(发酵理论)相关理论,对海洋药物集群知识流动与转化进行了研究,从知识流动视角并结合社会网络传播途径给出了集群知识升华模型,界定了集群知识升华的概念,形成了基于集群的知识流动与转化模型。(2)结合国家创新系统理论、区域创新系统理论、企业创新系统理论,从复杂系统视角,界定了集群创新系统的概念,并从集群知识溢出、知识流动、集群学习、集群协作竞争方面对集群自主创新的影响因素进行了分析,并构建了与集群创新相关的数学模型、关系模型与网络模型。。(3)通过构建集群知识流动模型、集群知识增长模型,通过社会网络分析方法对集群知识流动进行分析。建立集群知识网络的网络拓扑结构,并进行相关度量指标的计算分析。(4)通过实证研究发现,将集群中不同的节点在集群知识流动与创新过程之中的作用不同,可以发现利于知识流动与创新的核心节点,通过加强核心节点的建设,促进集群知识合理高效流动,加快集群自主创新步伐。