多发性硬化(multiple sclerosis，MS)是一种常见的以中枢神经系统脱髓鞘为特征的自身免疫性疾病。常见于20-40岁的中青年，女性多见，致残率高，至今尚无特效疗法。尽管MS的首次病理报告已有160多年的历史，但MS的确切病因和发病机制仍有许多问题未阐明。因此，MS成为神经免疫领域的研究热点之一。到目前为止，国内对MS的研究尚缺乏系统的研究，多停留在经典实验生物学研究水平，国外在近两年仅有几篇相关文献报道。 目的：寻找并鉴定多发性硬化患者脑脊液特异蛋白，为多发性硬化发病机制提供线索，并为临床诊断和治疗提供依据。 方法：通过腰椎穿刺的方法收集多发性硬化的脑脊液标本等量混合作为实验组，然后将临床筛检排出后的其他神经系统疾病患者脑脊液标本等量混合作为对照组。采用固相pH梯度双向凝胶电泳分离总蛋白质，凝胶经银染色后，Image Master 2D platinum5.0图像分析软件进行比较分析、识别差异表达的蛋白质，应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱得到相应的肽质量指纹图谱，然后搜索数据库鉴定差异蛋白质点。 结果：从双向电泳图谱上获得50个蛋白质斑点，共鉴定出35种蛋白，其中有3个蛋白仅仅出现在实验组凝胶图谱，其他的全为正常人脑脊液蛋白。在2个差异蛋白中，有1个为其他研究者所发现，另外2个是本实验所发现的。 结论：本研究识别并鉴定了3个与多发性硬化疾病有关的特异蛋白，但这3种蛋白质与多发性硬化的确切关系有待进一步探讨。另外建立了多种生物物种标本的双向电泳技术平台，为蛋白质组学技术在生物学领域的广泛应用提供了支撑技术。