靴耳属Crepidotus （Fr.） Staude是丝盖伞科（Inocybaceae）仅次于丝盖伞（Inocybe）的第二大属。全世界超过200种，地理分布广泛，是森林常见木材腐朽菌，在生态系统的物质循环中扮演着重要的角色。靴耳属一些种类，如软靴耳Crepidotus mollis（Schaeff.） Staude等具有一定的食用价值，此外，靴耳属种类能产生抗癌的生物活性物质，在医药领域具有潜在的应用价值。靴耳属个体小、种类多、种间关系复杂、种内变异丰富，是一个鉴定和分类难度较大的类群。中国该属种类约占世界种类的1/7左右，但一直缺乏系统的研究。本研究秉承多相分类的研究理念，采用传统分类与现代分子系统学相结合的方法对中国靴耳属真菌进行了系统的研究。首先在野外采集和调查工作基础上，获取物种宏观形态特征及生态习性特征，查阅国内各大标本馆馆藏标本进而进行形态学研究，然后采用ITS、nLSU、rpb2多基因序列，从靴耳属及相关类群系统位置、属内框架、属内种间及复合种内4个层次分析获得对靴耳属系统发育树，探讨其系统发育关系，丰富和完善各级系统框架。（1）分类学研究对自采的235份标本和186份国内各大标本馆的馆藏标本进行了形态学研究，共鉴定出36个分类群（包括种和变种），拟定新种6个，发现中国新记录种12个。其中，拟定的6个新种：吉林靴耳Crepidotus jilinensis T. Bau&S.S.Yang、海南靴耳C. hainanensis T. Bau&S.S. Yang、小白靴耳C. albidus T. Bau&S.S.Yang、小靴耳C. sinuosus T. Bau&S.S. Yang、树皮生靴耳C. cortiola T. Bau&S.S.Yang和橙红靴耳C. lutescens T. Bau&S.S. Yang。12个中国新记录种：阿拉巴马靴耳C. alabamensis Murril、美鳞靴耳小鳞变种C. calolepis var. squamulosus （Cout.）Senn-Irlet、朱红靴耳C. cinnabarinus Peck、长柔毛靴耳C. epibryus （Fr.） Quél、地生靴耳C. autochthonus J.E. Lange、拟球孢靴耳C. cesatii （Rabenh.） Sacc、粗孢靴耳C.lundellii Pilá、亚疣孢靴耳C. subverrucisporus Pilát、普通靴耳C. vulgaris Hesler&A.H.Sm、趾状靴耳C. carpaticus Pilát、分枝靴耳C. ehrendorferi Hauskn.&Krisai和拟叶斑靴耳C. sublatifolius Hesler&A.H. Sm。同时中国曾记载的种类中，C. cystidiosus Hesler&A. H. Sm.等3个分类群或凭证标本因错误鉴定或而排除其在中国的分布；C.kauffmanii Hesler&A. H. Smith等7个分类群由于记录和报道不详，缺乏引证标本，或与原始描述或国外权威文献记载存在一定的差异，暂作为存疑种处理。根据来自中国的材料对每个分类群进行了详细的形态学描述和显微线条图绘制，编写了中国靴耳属分种检索表。（2）分子系统学研究对产自中国的材料进行测序，共得到自测序列120条。基于nLSU序列对靴耳属及相关类群构建系统发育树分析表明：靴耳属作为一个单系类群得到了很好的支持，与木生的绒盖伞属Simocybe和侧火菇属Pleuroflammula形成姊妹群；与形态或生态特性接近的类群，如亚侧耳属Hohenbuehelia、侧耳属Pleurotus、贝伞属Conchomyces等亲缘关系较远，以往认为与靴耳属关系密切的丝膜菌属在系统发育上关系也较远。采用三个基因片段（nLSU、rpb2、ITS）分别对靴耳属下框架进行了系统重建，结果表明：这三个基因片段对于靴耳属下的主干分支均有较好的区分度，但各主干分支和次级分支的拓扑结构存在一定的差异，而三个基因片段联合分析各分支均获得更高的支持率，对于靴耳属下各主干分支（“亚属”）的组级框架揭示能力各有不同。其中rpb2片段对靴耳亚属下框架以及Autochthonus分支、Dochmiopus分支和Sphaerula分支的组级框架有所揭示；ITS片段对Crepidotus分支和Dochmiopus分支的组级框架有所揭示。采用ITS序列对广布种软靴耳复合种（C.mollis complex）进行了种内系统发育分析表明，ITS序列在复合种的系统发育分析中显示出一定的分辨能力。不同产地的材料在系统发育上与地理分布存在一定的相关性。保守认为，这个复合种下至少存在3个进化分支。