本文以在闽台两地影响深远、俗称“祖师公”的漳州三平祖师和泉州清水祖师为研究对象,通过文献史料、碑文记载、民间传说和网上资料,运用历史学和人类学的综合比较方法详细考察了闽台祖师公信仰的由来、发展、信仰特质、宗教属性、社会教化功能及对闽台两地文化交流和旅游合作开发的重要作用。我们认为,祖师公信仰经历了由一代高僧向佛教俗神演变的过程,是中原佛教与福建闽南本地民间信仰相融合的产物,属民间信仰中的佛教禅师崇拜。通过对祖师公信仰社会功能和作用的分析,我们认为,虽然同其他民间信仰一样,祖师公信仰具有两重性,但我们要着重看到其包含的中华传统伦理道德规范及在传承文化传统、促进区域经济发展、加强区域认同和社会整合方面的积极作用。随着福建海西经济建设的发展和闽台互动的增强,加强闽台祖师公信仰文化的交流和旅游开发无疑具有现实的意义。