水稻rARF基因的克隆和鉴定水稻功能基因的电子克隆

来源 :复旦大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:duoduodehua
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植物生长素应激因子ARF(Auxin Reponse Factor)家族是植物中起源较早的一类基因.1997年,第一个ARF基因在拟南芥中被克隆,命名为ARF1,此后T.Ulmasov小组利用同源区段非严紧杂交相继在cDNA文库中筛选到十几个拟南芥ARF类基因并对其功能作了一定研究.除了已经发现并命名的40多个ARF类基因外,在已完成全测序拟南芥基因组中,通过计算机注释,还发现了数十个候选ARF基因.说明这是一个比较庞大的家族,除了ARF2(原命名为ARF1结合蛋白,ARFI-BP)ARF3外,ARF家族基因都包括2个保守区段,即DNA结合区DBD和蛋白相互作用区AUX/IAA,其中DBD能够和生长率应答元件AuxRe“TGTCTC”结合.形成二聚体.研究表明ARF类蛋白在活体内通过二聚体或多聚体作用,而DBA和AUX/IAA两个功能域由连接区(MR)相连,ARF家族不同成中之间的判别主要来源于DBD和AUX/IAA之间的联接区,这一区段的不同氨基酸组成决定该基因上调或下游基因转录,其中富含Q的连接区能够上调下游基因表达,而富含P的连接区则下调下游基因表达./
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