城郊结合部作为城市与乡村的重要边界地区,对城市人口的粮食供应及畜禽粪便等生物废弃物的处理起着重要作用,施用畜禽粪便制成的有机肥能改善土壤理化性质、增加土壤肥力及提高农产品质量等,但是有机肥中含有的重金属和抗生素抗性基因会在连续大量施加过程中进入土壤造成一定的环境风险,城郊结合部有机肥增施的环境效应越发受到重视。本研究以中国典型城郊结合部-浙江省宁波市海曙区鄞江镇为研究地点,利用野外lysimeter系统,研究真实环境下不同施肥方式（不施肥-CK,化肥处理-CF,50%猪粪有机肥替代化肥处理-M50和100%猪粪有机肥替代化肥处理-M100）对稻麦轮作和蔬菜连作种植体系中典型重金属Cu、Zn和抗生素抗性基因（tet A,sul1,sul2）及int I1的累积和迁移的影响,并利用室内盆栽实验初步讨论土壤盐度升高对有机肥增施的环境效应的潜在影响。主要研究结果如下:1、稻麦轮作系统中,有机肥替代化肥施用促进了作物生长,改善了土壤理化性质,提高了土壤肥力。与化肥相比,施加有机肥使小麦地上部生物量显著增加,有机肥增施提高了土壤p H和电导率（EC）、土壤总氮（TN）、总磷（TP）、有机质（SOM）含量和阳离子交换量（CEC）。有机肥增施不仅造成土壤Cu、Zn的大量累积还对土壤Cu、Zn的赋存形态造成显著影响,有机肥处理组有机态Cu占比最高,铁锰氧化物结合态Zn占比最高,残渣态Cu、Zn占比均降低,增加了Cu、Zn的生物可利用性,造成小麦籽粒Cu、Zn含量显著增加。有机肥增施还造成土壤Cu、Zn表层和亚表层积累效应,有机肥增施提高了土壤Cu纵向迁移的风险,而土壤Zn主要在土壤表层（0-20cm）积累。有机肥增施增加了抗生素抗性基因在土壤剖面的迁移风险,促进了目标基因（int I1,tet A,sul1,sul2）在土壤剖面内的积累富集,施加化肥可显著增加土壤剖面磺胺类抗性基因（sul1,sul2）的丰度,而对tet A和int I1影响不大。2、蔬菜连作系统中,有机肥与化肥处理都显著提高了土壤电导率,相比较CK组,M100处理组,M50处理组和CF处理组的土壤EC分别增加了432.23%,474.05%,448.40%。有机肥增施造成Cu、Zn在土壤中大量积累,并改变了土壤Cu、Zn的赋存形态,有机肥处理组中有机态Cu占比最高,残渣态Cu所占比例显著降低,而Zn的形态分布格局未改变,残渣态Zn所占比例最高。有机肥增施促进了Cu、Zn在土壤剖面的迁移,提高了土壤剖面抗性基因的相对丰度。与稻麦轮作系统相比,蔬菜连作系统施加有机肥造成Cu、Zn和抗性基因在土壤积累和迁移的风险更大,还可能引起氮、磷超标和土壤盐渍化风险。3、土壤盐度升高对植物生长、土壤Cu、Zn的迁移转化及土壤抗性基因的丰度都产生显著影响。低土壤盐度促进植物生长而高盐度会抑制植物的生长,土壤盐度升高影响植物对营养元素的吸收,光合色素的合成,促进土壤Cu和Zn可交换态显著增加,并影响了抗性基因的相对丰度,其中sul1和tet A的相对丰度随土壤盐度升高显著降低,sul2和int I1的相对丰度随土壤盐度的升高显著升高。综上所述,对稻麦轮作系统和蔬菜连作系统,有机肥替代化肥施用均会增加Cu、Zn向作物体内富集及Cu、Zn和抗性基因在土壤剖面迁移的风险,土壤盐度升高会进一步提高Cu、Zn的生物有效性,影响抗性基因的丰度变化。本研究为连续施用有机肥替代化肥提供经验证据,在沿海城郊结合部有机肥增施的农业实践中,要加强重金属及抗性基因的风险防控。