本文采用规范与实证相结合的研究方法对公司治理结构与审计意见的相关性进行研究。首先对审计意见基本理论及影响因素的理论研究进行文献回顾与评述;接着对公司治理结构进行相关的理论回顾并分析了公司治理结构与公司经营绩效的相关性;然后,结合上文的文献回顾与理论研究,对公司治理结构与审计意见之间的相关性进行理论分析并为下一步实证研究提出假设;第五章则采用实证研究方法,把2006年取得非标准无保留审计意见的上市公司按一定标准与取得标准无保留审计意见的上市公司进行配对,采用Logistic回归分析方法,从股权结构、董事会特征两个方面进行公司治理结构与审计意见相关性的实证检验;实证结果表明,实际控制人为国有的公司收到标准无保留审计意见的概率比较大,现阶段第一大股东持股比例对审计意见类型没有显著影响,代表股权制衡度的第二到第四大股东的持股比例对审计意见类型也没有显著影响,而流通股比例越高的公司收到标准无保留审计意见的概率越大。通过对董事会特征与审计意见相关性的实证检验,发现董事会特征均与审计意见类型没有显著的相关性。