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【背景及目的】国外GWAS研究中表明CACNA1C基因上的内含子3及内含子9上的多态位点的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)与原发性失眠相关,而该基因的单核苷酸多态性是否增加中国汉族人群原发性失眠的易感性尚未知。另外,鉴于外显子、3’非翻译区(3′-untranslated region,3’UTR,)的重要作用,本研究首次探索了CACNA1C基因内含子3和内含子9、外显子、3’UTR的SNPs与中国汉族人群原发性失眠的易感相关性,为原发性失眠的病因研究提供依据。【方法】本研究采取病例对照研究,选取南华大学附属第二医院神经内科睡眠医学中心2016年7月至2018年12月诊治的原发性失眠患者205例。同期体检健康的中国汉族人群154人作为对照。使用NCBI数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)及结合GWAS研究,共筛选出CACNA1C基因的25个SNP位点。运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(Matrix assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)对CACNA1C的21个SNP位点进行基因分型检测,分别分析不同基因型及等位基因频率的分布与原发性失眠的易感相关性。应用SPSS22.0软件进行卡方检验。应用Haploview4.2软件进行连锁不平衡分析和单倍体分析。【结果】1.本研究所检测的位于CACNA1C基因上的21个位点,在中国汉族人群中,均是SNP位点。2.CACNA1C基因多态性结果检测显示:1)内含子9的rs2302729位点TT、TC、CC基因型频率在失眠组和对照组之间比较有统计学意义(P=0.019),且两组比较携带有C等位基因的纯合子和杂合子(CC+CT)基因型与纯合子TT基因型的频率分布差异有统计学意义(P=0.005,OR=2.410,95%CI[1.283~4.526]);两组等位基因(C、T)频率分布差异有统计学意义(P=0.023,OR=1.426,95%CI[1.049~1.938])。2)外显子rs1051375位点AA、AG、GG基因型在失眠组和对照组之间分布有统计学意义(P=0.041);且两组比较携带有A等位基因的纯合子及杂合子(AA+AG)基因型和纯合子GG基因型的频率分布差异有统计学意义(P=0.013,OR=2.715,95%CI[1.165~4.064]);两组等位基因(A、G)频率分布差异有统计学意义(P=0.031,OR=1.404,95%CI[1.032~1.909])。3)外显子rs216008位点TT、TC、CC基因型在失眠组和对照组之间分布有统计学意义(P=0.041);且两组比较携带有C等位基因的纯合子及杂合子(CC+CT)基因型和纯合子TT基因型的频率分布差异有统计学意义(P=0.008,OR=2.455,95%CI[1.246~4.836]);但两组等位基因(C、T)频率分布无统计学意义(P﹥0.05)。4)余基因位点基因型及等位基因频率分布均无统计学意义(P﹥0.05)。3.在CACNA1C中,本文所研究的多态位点中存在三个强连锁不平衡单体域(r2>0.8):rs2302729-rs1051375;rs7316264-rs12809807-rs10466907-rs4765975-rs7957163;rs7316184-rs7304986-rs7301906-rs16929275-rs16927276-rs2051990,根据block构建原则在三个强连锁不平衡单体域中构建了2个block:rs2302729-rs1051375;rs7316264-rs12809807-rs10466907-rs4765975-rs7957163;以便于单体型分析。4.CACNA1C基因多态位点的单体型rs2302729-rs1051375 CA和T G,均与原发性失眠相关(P均<0.05)。单体型rs7316264-rs12809807-rs10466907-rs4765975-rs7957163 GCTAC和AAGTA,均与原发性失眠无关(P均>0.05)。【结论】1.本研究首次发现CACNA1C基因外显子rs1051375、rs216008和中国汉族人群原发性失眠的易感性相关,而3’UTR SNPs和原发性失眠的易感性无关。2.在CACNA1C内含子中仅发现内含子9 SNP rs2302729和中国汉族人群原发性失眠的易感性相关。