2009年10月,深圳证券交易所批准二十八家中小企业发行上市,这标志着我国筹备了十年的创业板市场正式启动。创业板是独立于主板的二板市场,它的开通协助一些高科技企业进入一个快速发展的阶段,也在一定程度上有力地配合了国家的相关政策。当前,我国创业板市场在运行中出现了较为突出的新股抑价问题,这严重地影响了资本市场的运行效率。我国以往对创业板市场IPO抑价的研究大多放在二级市场投资者行为的非理性上,而从股权结构的角度来研究创业板市场IPO抑价的文章屈指可数。本文在总结国内外IPO抑价理论研究成果的基础上,以2009年10月至2014年4月375家创业板上市公司为样本,采用实证研究方法,试分析代表公司股权结构的各类关键性指标是如何影响投资者对公司价值的判断,进而影响创业板市场的IPO抑价率。研究发现,创业板上市公司第一大股东持股比例与IPO抑价呈显著的负相关关系,流通股比例、留存比例与IPO抑价呈显著的正相关关系,而股权制衡度、高管持股比例、机构持股比例与IPO抑价关系并不显著。由此,本文提出了适度降低第一大股东持股比例、提高信息披露程度、优化股权结构、加强监管、培育理性成熟的投资者等建议。