中国木瓜（Chaenomeles）栽培历史悠久，品种资源丰富，发展前景广阔，但良种化生产和定向培育程度较差。本文以山东省木瓜资源为研究对象，开展了木瓜种质遗传多样性研究，从果用的角度对选育的木瓜新品种进行了系统评价，取得的结果如下：1.利用AFLP分子标记技术对40个木瓜品种（包括6个皱皮木瓜主栽品种，3个皱皮木瓜新品种，10个皱皮木瓜杂交品种；16个光皮木瓜品种，1个光皮木瓜新品种，4个光皮木瓜杂交品种）进行遗传多样性和群体遗传结构进行了分析，从分子水平为木瓜分类和优良品种的鉴别奠定了基础。7对PstI/MseI引物共扩增出1195条带，其中多态性位点数为1195条，多态性位点的百分率为100%，平均每对引物扩增出170.7条带，揭示了木瓜资源丰富的遗传多样性。对皱皮木瓜扩增出822条多态性条带，平均每对引物扩增117.4条，多态率在63.02%～81.33%，平均为68.79%。对光皮木瓜共扩增出1045条多态性条带，平均每对引物扩增149.3条，多态率在77.33%～94.71%，平均为87.45%。7对引物共产生单态带210条、缺失带5条，共215个特异性位点，占总扩增条带的17.99%，其中皱皮木瓜扩增出60个特异性位点（58条单态带，2条确实带），光皮木瓜扩增出155个特异性位点（152条单态带，3条缺失带）。40个木瓜品种的4个遗传多样性参数（等位基因数目Na、有效等位基因数目Ne、Nei基因多样性H和Shannon信息指数I）个体水平都明显高于各种内水平，光皮木瓜各参数均高于皱皮木瓜，因此，遗传多样性水平为个体水平＞光皮木瓜＞皱皮木瓜。木瓜的总基因多样性度Ht=0.2019，平均基因多样度Hs=0.1712，遗传分化系数Gst=0.1502，Gst基因流Nm=2.9677，显示种间的遗传变异占总变异15.02%，种内的遗传变异占总变异的84.98%，2个种间存在一定的基因交流。两个种的遗传相似系数在0.8883～0.9621之间，平均为0.9257；遗传距离在0.0386～0.1185之间，平均为0.0723，表明虽然种间有一定的变异幅度，但种间的相似程度还是相对较高，遗传距离较小。在40个木瓜品种间，相似系数介于0.1795～0.8088之间，平均相似系数为0.4610。皱皮木瓜相似系数在0.3702～0.8088之间，平均为0.7545。光皮木瓜相似系数在0.2527～0.6741之间，平均为0.5654。因此，皱皮木瓜品种间亲缘关系较近，光皮木瓜品种间亲缘关系相对较远。皱皮木瓜新品种翠绿与一品香相似系数较高，青秀与红霞相似系数最高，锦绣与一品香相似系数最高。光皮木瓜新品种可食与手瓜相似系数最高。皱皮木瓜以长俊做亲本进行杂交育得的子代与长俊的相似系数都较低，而与另一亲本相似系数较高。以红霞、一品香做母本进行杂交得到的子代与一品香相似系数较高。光皮木瓜在以细皮做亲本时子代都与另一亲本的相似系数相对较高。杂交品种间相似系数较高。在0.40处将40个木瓜品种可以分为4类：第一类为皱皮木瓜和光皮木瓜细皮；第二类为除了细皮、陈香、果大、短柄果勾外的光皮木瓜；第三类为果大、短柄果勾；第四类为陈香。第一类又分为三组：长俊、皱皮木瓜（长俊除外）和细皮。2.木瓜新品种保持了皱皮木瓜或光皮木瓜特有的性状，在果皮贮藏后是否皱缩、托叶、有无棱沟、花期、树形等性状与主栽品种相同。皱皮木瓜新品种可以通过果形、果色、叶形、皮孔、香味、叶片硬度、汁液、果实大小、成熟期等方面进行区分。光皮木瓜新品种可食可以通过果形、果色、花色、果实质地、汁液、香味、耐储性等性状区分。3.皱皮木瓜各品种间含水量差异较小；新品种蛋白质含量、维生素C含量都较主栽品种低；总糖含量新品种较长俊低，较罗扶高；翠绿和青秀较主栽品种总酸含量低，而锦绣则较主栽品种总酸含量高；新品种较主栽品种粗纤维含量低，最低的为青秀，最高为翠绿。光皮木瓜新品种部分营养指标（含水量、蛋白质、粗纤维含量）介于细皮和豆青之间，其余的营养指标（总糖、总酸、维生素C含量）则低于主栽品种。皱皮木瓜含水量、含酸量较光皮木瓜高，蛋白质含量、粗纤维含量较光皮木瓜低。所有新品种总的氨基酸含量比主栽品种总的氨基酸含量低，但是必需氨基酸占氨基酸总量的比例（EAA/TOTAL）较主栽品种高，必需氨基酸与非必需氨基酸的比值（EAA/NEAA）较大，蛋白质品质较高。其中皱皮木瓜新品种青秀的必需氨基酸含量最高，翠绿和锦绣必需氨基酸含量较低，光皮木瓜新品种可食的必需氨基酸含量较主栽品种的高。青秀、翠绿和可食EAAI较高，更接近人体氨基酸比例，利于人体对氨基酸的利用，其蛋白质的质量更好。新品种翠绿铁、钠、锰、钙、镁含量都高于皱皮木瓜主栽品种；青秀铁、钠、锰、钾、镁含量高于主栽品种；锦绣铁、钠、锰、钾、钙、镁含量高于主栽品种；可食铁、钠、锰、钾、钙含量高于主栽品种；新品种其他矿质元素含量为一般水平。木瓜营养品质综合评价得分显示：光皮木瓜营养品质比皱皮木瓜高；皱皮木瓜中，新品种青秀的营养品质较好，锦绣的营养品质只较长俊高，较罗扶低，翠绿的营养品质最低；可食营养品质较细皮高较豆青低，但是都相差不大，符合光皮木瓜果实的一般要求。新品种青秀、翠绿、可食都可以作为较好的原料进行食品加工等。4.木瓜果实的纵径、横径、鲜重在发育阶段都呈正向增加。含水量均在生长初期较高，随着果实的生长逐渐下降，中期后开始逐渐上升，果实成熟时达到最大值。可溶性固形物含量、可滴定酸含量、可溶性糖含量、总酚相对含量、花青素相对含量呈单峰型，峰值时间有差异。木瓜果实采摘时的固酸比值都比果实发育初始时的值小，但是发育过程中有波动。木瓜果实发育期间品质逐渐变好。皱皮木瓜新品种品质介于长俊和罗扶间，适合推广种植，其中锦绣与翠绿高于青秀。罗扶和青秀可以较长俊、翠绿、锦绣提前采摘。新品种锦绣和翠绿采摘时间上可以参照长俊，青秀可以参照罗扶。光皮木瓜新品种可食营养品质后期上升较快，因此，供果时间长。相关性分析显示，可滴定酸与可溶性糖相关性最密切。5.新品种果型匀称，大小适中，适于加工，产量明显高于传统品种，只有翠绿较长俊的产量稍低，因此，新品种可以作为优良的木瓜品种进行广泛栽植。