福建省自2009年启动公立医院综合改革,2011-2014年对全省县级公立医院全面实施综合改革,2015年以列入国家医改综合改革试点为契机全面实施了城市公立医院综合改革。在“深化医药卫生体制改革,全面建立中国特色基本医疗卫生制度”的医改背景下,通过对公立医院经济运行效率测算,找出能够显著影响医院效率的因素,并对这些因素进行有针对性的改进,以提高医院效率显得尤有意义。本研究主要目的在于探讨公立医院经济运行效率以及影响因素。首先,以福建省164家公立医院做为观察对象,样本包含2009-2015年共计7年的年度资料,投入项为实际开放床位、年末在职职工人数、固定资产及总支出,产出项为出院人数、门急诊人次数及床位使用率,并运用资料包络分析法(DEA)中的CCR与BCC模式来测量各医院效率。经计算后发现:1.2009-2015年样本医院总体效率和规模效率水平均处于中效率区间,且呈下降趋势。纯技术效率水平处于较高效率区间,且总体呈上升趋势。绝大部分样本医院处于规模不适宜状态。2.各地区医院总体效率、规模效率间存在差异,一类及二类地区样本医院总体效率、规模效率均高于三类地区样本医院。3.各等级医院总体效率、纯技术效率、规模效率间的差异均具有显著性意义,其中省级样本医院各项效率均高于市级样本医院。其次,利用Tobit回归模型分析发现,每职工平均门急诊人次均对总体效率、纯技术效率、规模效率产生正面影响。人员支出占业务支出比例、病床周转次数对总体效率、纯技术产生正面影响。药品收入、出院者平均住院天数对规模效率产生负面影响。然后,结合GM(1,1)与DEA模型,预测2016年10家省级公立医院的效率值,其中,总体效率平均值为0.926、纯技术效率平均值为0.966及规模效率平均值为0.959。以非有效医院DMU1为例,与DEA有效的医院相比,该医院多投入了 6.26%的床位,22.11%的职工,12.69%的固定资产及13.22%的总支出。最后基于上述分析以及相关背景和政策导向对公立医院经济运行效率的改善提出建议。本研究的创新点在于:首次将灰色预测法和DEA法结合,既进行效率的现况评估又实现了预测未来的功能。另外,本文在指标筛选时,先进行文献统计,后结合聚类分析方法进行筛选,更具研究的严谨性。