跨平台、分散的异构资源的整合是当前生物信息学领域的主要研究热点之一。本论文提出并建立了一种全新的生物信息集群系统。该系统利用Rocks集群技术，通过网络平台建立了一个虚拟的工作环境，可帮助科研工作者实现可定制的综合性的生物信息学计算工作。用户可以在自己的办公室里通过该生物学信息系统所提供的终端浏览器界面来定制和提交完整的生物信息学查询和计算请求。 在本文中，我们提出并建立了一个基于Rocks的生物计算集群系统，以充分利用现有的高性能集群计算平台来提高生物学数据的处理和分析能力。通过采用Rocks roll的开发技术，快速整合现有生物信息学计算工具；基于自动任务调度和分配机制，充分利用网络中现有的生物信息软硬件资源；通过开放的Portal技术，将用户繁琐的计算需求实现为一种基于web界面的便捷模式。 系统的最大特点在于快捷安装和易于使用。生物信息集群系统的构建是一种全自动的方式，方便、快捷而且成本低廉，使得科研工作者能以最小的管理成本迅速的开展数据分析工作。大约仅需30分钟，用户就可以通过一个功能强大且易于使用的Web界面来启动BLAST、HMMER、EMBOSS以及更多的软件，整个安装过程将自动在计算集群上部署超过20种的生物信息学应用程序。该系统开发的核心技术可以被扩展应用到其他学科的科学研究领域。 本课题研究来源于与SUN公司的亚太科技中心的合作项目“Enhance BioBox Project”。目前该系统能够支持并行的复杂任务计算，用户可以提交一个或多个输入文件，并以指定方式同时查看多个输出结果。用户可以方便的使用该生物信息学计算系统。