红树林海榄雌瘤斑螟ISSR遗传多样性分析

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以ISSR为分子标记,对采自深圳福田(17个个体)、惠州大亚湾(4个个体)、厦门集美(4个个体)、福建云霄(12个个体)共4个种群38个个体的海榄雌瘤斑螟(Ptyomaxiasp.)进行分子遗传多态性研究。采用酚/氯仿法提取海榄雌瘤斑螟基因组DNA,筛选合适的ISSR引物进行随机扩增,统计“0,1”数据,用Popgene、Phyltools和Mega软件进行数据分析,检测其遗传分化程度,并建立海榄雌瘤斑螟不同个体和不同种群之间的遗传关系。实验共筛选出13条引物用于海榄雌瘤斑螟样本的随机扩增,共获得297个扩增位点。数据分析显示,深圳福田种群检测出的位点最多,为230,惠州大亚湾最少,为103。多态位点比率以深圳福田个体最高,为77.44%,以惠州大亚湾的个体最低,为34.68%;由Neis指数计算的遗传一致度和遗传距离得出,海榄雌瘤斑螟4个种群遗传一致度在0.9610~0.9844之间,遗传距离在0.0157~0.0397之间,表明海榄雌瘤斑螟不同种群之间存在一定程度的遗传差异,但差异不大。分别构建海榄雌瘤斑螟不同个体之间以及不同种群之间的UPGMA和NJ聚类图,得到基本一致的聚类关系。系统树均显示,海榄雌瘤斑螟不同种群之间的聚类没有完全按地域差异相聚,四个种群的个体共形成4个聚类簇,来自深圳福田的个体分别聚在两个分支中,一部分与惠州大亚湾的个体相聚在一起,另一部分独立成支。惠州大亚湾的个体分为两大聚类,部分个体与深圳福田的个体相聚在一起;厦门集美的个体与福建云霄和惠州大亚湾的少部分个体相聚在一起成为一支,总体上看,海榄雌瘤斑螟不同种群个体之间的聚类关系与地理距离有一定的关系,有部分个体可能由于各种自然或人为的因素引起了种群之间的基因交流而出现交叉聚类关系。构建4个种群之间的UPGMA和NJ聚类数,结果显示,二者得到基本一致的聚类关系,深圳福田和福建云霄的种群先聚合,然后再与厦门集美的种群聚合,最后于惠州大亚湾的种群聚合,深圳福田和福建云霄这两个种群的亲缘关系最近,然后与厦门集美种群接近,而惠州大亚湾种群的亲缘关系与其他三者相聚最远。
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