随着水电事业的迅速发展，水电站工程对环境的影响也受到了越来越多的关注。水电站工程的生态环境影响评价涵盖的方面较多，问题非常复杂，一直都是理论界的一个研究热点。就水电开发中所产生的环境问题而言，主要体现在陆域生态环境及水环境两个方面。本文对水电站工程的生态环境影响评价进行了研究，论文中主要包括以下几个方面的内容：1)从陆域生态环境完整性及环境敏感性，水域水生态系统，社会发展等方面构建复合生态系统影响因子指标体系，识别影响水电站工程复合生态系统关键因素。2)以景观生态学基础理论为指导，结合遥感与地理信息系统技术，探讨水电站工程对区域陆域生态环境影响评价的理论方法。从景观空间结构及功能稳定性的角度量化水电站工程对区域生态环境的影响程度，构建了适用于水电站工程的景观指数。运用该方法，为今后水电站工程中对生态环境的影响进行预测，提供一个定性与定量相结合的评价方法，为最大限度的降低水电站工程对生态环境的影响提供了决策依据。3)本文采用水流-水质耦合模型研究水电站工程对水域环境的影响，模型采用有限体积法对构建的二维水流—水质模型进行求解，界面通量求解采用黎曼近似解通量Osher格式。该方法为水电站工程中对水域环境的影响进行预测提供了一个定量的分析方法。4)以江苏马山抽水蓄能电站工程为例进行实例研究：根据前面所述的方法，在确定电站预测评价因子的基础上，运用景观生态学及数学模型法分别进行了陆域及水域的生态环境影响评价。结果表明，区域的景观生态完整性并未因工程建设受到较大影响：电站抽、放水使竺山湖湖区的局部流场发生改变，对电站附近的竺山湖水域的水质有所影响，但影响并不明显，对远离电站的太湖水质影响微小。