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本实验选取年龄相近的青年荥经长毛兔、天府黑兔和加利福尼亚兔为实验材料，通过PCR产物直接测序法分析FGF5基因外显子Ⅰ和Ⅲ的遗传效应，及其与毛兔的产毛量、肉兔的屠宰性能的相关性。结果表明：FGF5基因外显子Ⅰ和Ⅲ中共发现了3个多态性位点，在外显子Ⅰ的TCT位点，毛兔中A基因的频率为0.800，是优势基因，肉兔中B基因的频率为0.900～0.950，是优势基因；在外显子Ⅲ的位点1，毛兔中C基因的频率为0.750，是优势基因，肉兔中T基因的频率为0.775～0.825，是优势基因；在外显子Ⅲ的位点2，毛兔中T基因的频率为0.600，是优势基因，肉兔中T基因的频率为0.575～0.650，是优势基因。FGF5基因外显子Ⅰ的TCT位点，平均PIC值为0.174，属低度多态性；FGF5基因外显子Ⅲ位点1的PIC为0.280，FGF5基因外显子Ⅲ位点2的PIC为0.363，均属中度多态性。相关性分析结果表明：荥经长毛兔11月份体重与11月份剪毛量间达极显著正相关水平(P＜0.01)，11月份体重与1月份体重间达极显著正相关水平(P＜0.01)，11月份剪毛量与1月份体重间达极显著正相关水平(P＜0.01)，1月份体重与1月份剪毛量间达极显著正相关水平(P＜0.01)。最小二乘分析FGF5基因各位点与生产性状间的相关性结果显示：FGF5基因的外显子Ⅰ的TCT位点对荥经长毛兔剪毛体重、产毛量及饲料转化率的影响不显著。FGF5基因外显子Ⅲ中位点1的CC基因型个体11月份剪毛量极显著高于TT基因型个体11月份剪毛量(P＜0.01)，TC基因型个体的1月份剪毛体重显著高于TT基因型1月份剪毛体重(P＜0.05)，CC基因型个体的1月份剪毛量极显著高于TT基因型个体1月份剪毛量(P＜0.01)；FGF5基因外显子Ⅲ位点2两种基因型中TC基因型个体11月份及1月份剪毛量均显著高于TT基因型个体(P＜0.05)。FGF5基因外显子Ⅰ和Ⅲ对天府黑兔和加利福尼亚兔屠宰率、熟肉率、贮水损失及饲料转化率的影响差异均不显著(P＞0.05)。对FGF5基因外显子Ⅰ和Ⅲ的遗传效应及其与长毛兔的产毛量、肉兔的屠宰性能的相关性分析表明：FGF5基因主要影响产毛量，可以做为长毛兔产毛性状连锁分析的候选遗传标记，并且本研究为其他产毛动物在研究FGF5基因与产毛性状间的相关性上提供了理论依据。