福建牡蛎(Crassostreaangulata)旧称僧帽牡蛎，是福建的重要养殖贝类。《2011年农业部渔业局》的数据显示，2010年福建省牡蛎养殖产量达1，456，106吨，占全国的40％，居全国首位，其中主要养殖品种为福建牡蛎。本论文对福建牡蛎生长相关基因和群体选育进行了研究，拟对福建牡蛎生长相关基因做深一步的了解，同时进行了福建牡蛎群体选育，有望为福建牡蛎良种选育提供理论支持。　　 本研究采用SSH、454/Roche转录组文库方法，建立牡蛎早期发育不同阶段cDNA文库。SSH文库随机调取672个克隆，送交上海生工测序。获得序列653条，测序成功率97.2％，将其数据进行拼接，得到Unigenes(contigs+singlets)553条，重复序列占测序成功序列15.3％。CAP3除去重复和小于100的低质量EST，得到有效EST553条，平均长度600bp，其中54个重叠组是由两条EST拼接而成，9条是3条EST拼接而成，3条是由4条或4条以上EST拼接而成的。非冗余序列占全部有效测序序列的71.51％。　　 454/Roche转录组文库共得到566917条EST，平均长度319bp。牡蛎发育的8个时期通过添加不同的物理标签用以区分，去除接头和小于60bp的短片段之后，剩余555215条序列，共173Mb，平均长度309bp。对所得数据进行拼接得到了10462条contig，112366条singleton。Contigs平均长度723bp，singleton平均长度275bp，6878条contig长度超过500bp，1907条contig长度超过lkb。所有基因最后可以Mapping到262个Pathway通路上，其中Pathway包含了生长、代谢、发育、信号转导和细胞膜离子泵等。基因波动最大的30条基因中有10条基因完全不能和genebank中的序列配对，说明双壳贝类可能在发育、生长、变态中具有独特的分子机制。　　 对454转录组中的IGF-like基因应用RNAi、定量PCR、免疫组化等方法进行了功能验证，其中RNAi干扰后的牡蛎生长速率显著比对照变慢，同时，干扰后的牡蛎其IGF在转录和翻译水平均下降。通过T7展示文库，淘选了一批和牡蛎IGF相结合的EST，根据EST序列，通过RACE实验，克隆了和牡蛎IGF相关的基因11条，分别是:细胞凋亡蛋白，DAP(death-associatedprotein);氯离子通路基因，CIC(Chlorideintracelluarchannel);福建牡蛎细胞凋亡基因，Gadda(growtharrestandDNA-damage-inducible，alpha);生长转录因子，RAs(RASdomainsubfamilybZIP);福建牡蛎同源基因，HOX(HOX12proteinisoform3);低密度脂肪受体，LDLtor(Low-densitylipoproteinreceptor);类胰岛素生长因子受体基因，IGFR(Insulin-likegrowthfactorreceptor)。　　 针对牡蛎生长性状进行了群体选育，2009年6月，本研究进行了漳浦北江养殖群体为亲本的群体选育，选育目标为生长快速性状。2010年9月和2011年11月分别进行了以生长快速为目标的第二代和第三代选育，选育效果显著，在90天日龄时，第三代选育组总湿重比对照组增加27.93％，差异显著(P＜0.01)。对选育三代群体进行遗传分析学分析，结果表明尽管选育三代，但选育后代仍具有很高的基因多态性(PIC＞0.5)，没有发生明显的近交衰退(P＞0.05)。　　 在对IGF及其相关基因和福建牡蛎的性状关联研究中，IGF的基因拷贝数和牡蛎湿重、软体重正相关，随着选育世代的进行，其IGF基因拷贝数增多，变异系数变小，PIC指数下降，IGF拷贝数可以作为一个候选功能分子标记，进而应用到牡蛎选择育种上。