辽宁省东北林蛙遗传多样性与环渤海地区林蛙系统发育研究

来源 :沈阳师范大学 | 被引量 : 6次 | 上传用户:hzbhwh
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
运用RAPD分子标记方法,对分布于辽宁省的4个东北林蛙种群的遗传多样性进行研究,以揭示辽宁省东北林蛙的遗传多样性水平、遗传变异和遗传结构,进而探讨东北林蛙种群间的遗传分化程度及其与其生境的关系,为合理利用东北林蛙资源提供科学的依据。通过对环渤海地区分布的林蛙线粒体16S rRNA基因序列分析,采用多种方法对其系统发育关系进行分析,探讨本地区林蛙动物的系统进化关系和演化机制,以期为从分子生物地理学角度探索环渤海地理形成及变化的过程提供帮助。一、从辽宁省桓仁、抚顺、本溪和阜新采集到4个自然种群的东北林蛙,通过RAPD分子标记,研究了东北林蛙的遗传多样性和遗传分化。主要分析了种群间的等位基因频率、多态条带百分率(PPL)、基因多样度(h)、基因分化系数(Gst)和Shannon多样指数等遗传参数,用非加权平均法构建系统树,并通过分子变异分析(AMOVA)来探讨遗传变异在个体、种群和地理区域等不同阶层中的分布格局。研究结果如下:(1)从23个随机引物中筛选出9个重复性好、多态性高的引物,对110个东北林蛙样本基因组DNA进行扩增,每个引物扩增出7-13个明显的片断,共检出95条带,全部表现出多态性,多态百分率100%。Shnnaon多样指数(I=0.1596)及Nei基因多样性指数(h=0.0821)均显示东北林蛙遗传变异程度比较低,遗传多样性相对缺乏。表现最为丰富的桓仁地区,Shannon多样指数也仅为0.2337,基因多样性指数为0.1341。(2)4个地理种群间基因分化系数(Gst=0.0231)较低,而群体之间每代迁移数很大(Nm=9.0219),说明各群体间基因交流比较多,群体之间无显著遗传分化。在基因多样性测度中,群体内基因多样性(Hs=0.0753)在总基因多样性(Ht=0.0771)中所占比例为97%。分子变异分析(AMOVA)结果,遗传变异主要来自于种群内(Fst=0.1210)。分析了6种林蛙30个样本的线粒体16S rRNA基因序列,结合已经发表的镇海林蛙和日本林蛙的同源序列,探讨了环渤海地区林蛙群的系统发育关系和生物地理演化。用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯推论(BI)构建了系统发育树。以基于Hierarchical Likelihood Ratio Tests(hLRT)的GTR作为ML/BI法最佳进化模型。得出以下研究结果和结论:(1)建立在系统发育基础上,建议将黑龙江林蛙种组(费梁等,2005)的桓仁林蛙划归中国林蛙种组。(2)徂徕林蛙的6条16S rRNA基因序列共享一个单倍型,结合其成体形态和蝌蚪唇齿式的研究结果,可以为其物种有效性提供佐证。(3)根据系统发育分析并结合地质学文献描述,我们认为日本林蛙、镇海林蛙和徂徕林蛙同属一个进化支,具有共同的祖先。
其他文献
溶剂萃取法是浓缩和提纯铀(Ⅵ)以及提取分离铁(Ⅲ)的主要方法之一。磷类萃取剂、亚砜类萃取剂、胺类萃取剂是其中较为重要的几类萃取剂。为了研制新型高效高选择性的绿色环保
荞麦是一种常见的双子叶农作物,其蜂花粉中含有丰富的蛋白质、多糖、矿物质、黄酮类化合物。有关荞麦蜂花粉中的多糖类化合物的研究还未见报道。为了研究和开发荞麦蜂花粉多糖,本文对荞麦蜂花粉多糖进行了系统的分离纯化,研究了各级分的单糖组成,理化性质及分子量,并对获得的多糖级分的结构特征进行了初步的探索,以期为蜂花粉多糖的应用提供理论基础和科学依据。干燥的荞麦蜂花粉经过热水提取、乙醇沉淀得到水溶性总多糖WFP
本文采自中国南海三亚附近海域的软珊瑚Sinulariagibberosa和柳珊瑚Subergorgiasp.进行了系统的化学成分和体外生物活性研究。以生物活性为导向,结合氢谱提供的核磁特征信号,采