农业是国民经济的基础,我国农业发展长期严重滞后,造成今天城乡经济、收入差距日益拉大;农村市场狭小,难以适应工业进一步发展的要求;在我国工业已进入新型工业化中期后,增大农业投入成为解决“三农”问题及许多社会问题的关键。我国农业投入制度形成于二元经济结构时期,国家实行工业优先发展策略的大背景下,农业长期难以形成自身资金良性循环。现行农业投入制度存在着许多的弊端和问题,越来越难适应工农业协调发展、城乡协调发展,社会稳定的要求。本文针对我国农业投入制度存在的主要缺陷,运用制度变迁理论、产权理论、公共产品理论、成本——收益分析理论说明了制度、农业投入制度的本质内涵、我国农业投入制度的历史演变以及制度方面的原因。本文认为目前我国政府对农业投入的主导意义大于一般市场经济国家,但最终农业的发展则有赖于自发的、市场化的投入,这就需要农业能象其它产业一样获取平均利润率。政府在农业投入方面发挥主导作用意味着:一方面各国政府都是农业投入的主体;另一方面更重要的是指政府是农业投入制度的供给者。通过政府的各种投入,创造保证农业投入获得平均利润率的硬件、软件市场环境,最终达到以社会与农户的投入为主体,增大农业投入的目的。文章从加强农业产业化、农村合作社等组织化建设;明确农业投入的范围;制度供给;投入方式创新;完善财政支农资金管理体制;完善立法、执法与审计保障等方面提出了政府增大农业投入的制度建议。