滩羊是以盛产裘皮闻名于世的一个地方绵羊品种,主要分布在宁夏及其周边相邻地区。滩羊二毛裘皮因其美丽的外观,良好的保暖性,柔软而又耐磨的特点而深受人们的喜爱,具有极大的市场价值。二毛裘皮的形成离不开毛囊的发育,作为毛囊发育的承载者—皮肤是本课题研究的重点,通过对滩羊胚胎后期以及胎儿早期的皮肤转录组学的研究,从而了解影响滩羊毛囊发育的内在因素。基于上述的背景,本研究主要进行了以下几方面的内容:（1）通过RNA-seq技术对滩羊妊娠85d、妊娠120d、初生期滩羊皮肤组织进行了转录组测序分析。以Log2FC>1.0,P<0.05为标准筛选差异表达基因,总共筛选出4567个差异表达基因。在Trans Ⅰ（妊娠85dvs妊娠120d）中有3752个差异基因,其中上调1764个,下调1989个。而在Trans Ⅱ（妊娠120d vs初生期）中有815个差异基因,其中上调327个,下调488个。随机选取10个差异表达基因进行qPCR验证（IGF1,IL1R2,AGTR1,THBS4,TBX15OSR1,SFR P2.DDIT4,LAMA1,NGFR）,结果显示验证基因的qPCR结果与RNA-seq结果的相关系数均在90%以上。通过构建韦恩图,结果显示三个时期共同表达的差异基因为410个。通过对差异基因表达分析发现IGF1基因对于滩羊毛囊的形成与生长具有促进作用,并且1GF1基因的表达量与滩羊毛囊的生长速度呈正比。（2）通过RNA-seq技术对滩羊初生期与二毛期皮肤组织进行了转录组测序分析。以Log2 FC>1.0,P<0.05为标准筛选差异表达基因,在滩羊初生期与二毛期滩羊皮肤中共筛选出364个差异表达基因,其中上调168个,下调196个。随机选择9个差异基因进行了 qPCR验证（FOS,K33,Krt35,GPRC5D,MYH11,TGFBR3,DES,LOC1 01113168,ELN）,结果显示绝大部分基因的qPCR结果与RNA-seq结果的相关系数在80%以上。通过对差异基因分析发现FOS基因对于滩羊的毛囊生长发育具有促进作用。上述研究为滩羊毛囊发育的内在机制提供了理论基础和参考依据。