水资源是一种既具有经济价值又具有生态价值、社会价值的自然资源,但是,水资源短缺的问题已经成为威胁中国经济社会可持续发展的重要问题。水资源短缺表面上是资源短缺,实质上是制度短缺,解决中国水资源短缺的问题的根本出路在于制度创新。所以,构建基于私法运行的水资源财产权法律制度是不二选择。随着历史的变迁,水资源为国家所有已经成为发展趋势,其在法律上亦已成为一种财产,配置模式逐渐市场化。水资源财产权法律制度就是要实现水资源所有权和水权的经济价值,其重要基点就在于水资源国家所有权的民事行使方式、初始水权的明晰和可交易水权制度的实现。但是,长久以来,中国的水资源财产权法律制度并没有真正建立,在以取水许可制度为核心的水资源法律制度中,国家是以行政权力对水资源进行配置,水权没有彻底明晰,并且由此产生的水权不具有财产权所必需的稳定性和可转让性,水资源的财产属性难以得到体现。虽然,在实践中,中国的水资源财产权法律制度有一定的突破,但还难以在立法层面得到支撑。物权法的颁布,给中国水资源财产权法律制度的构建奠定了坚实基础,水权被确立为用益物权,但是现行法律与此有诸多矛盾之处。要解决中国的水资源问题,必须以物权法的颁布为契机,重构水资源财产权法律制度。其要点有:一是改变水资源国家所有权的实现方式,构建水资源国家所有权代表的民事主体的地位,以民事方式行使水资源所有权;二是明确界定初始水权,以明确的法律制度规定初始水权的权利内容和取得方式;三是破除水权交易的法律限制,建立水权交易制度,实现水权的经济效益。此外,确立水权统一登记确认制度和水资源财产权民事救济制度对于水资源财产权法律制度的运作也具有重要意义。