食管癌基因谱与临床病理及预后的相关性

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第一部分食管鳞癌和正常食管黏膜组织中差异表达的基因筛选目的:筛选出食管鳞癌和正常食管黏膜中差异表达的基因。方法:从6例食管癌及癌旁组织中提取RNA,反转录合成的cDNA为探针,与微点阵表达分析膜进行差异杂交。统计比较两种组织中基因表达的差异。结果:自显影结果显示在所分析的488种已知基因中,Beta-catenin、wnt1、smad4等56个基因在食管癌组织中表达上调,ATM等8个基因表达下调,参与细胞增殖、凋亡、分化和转移调控的多种基因的表达水平发生了明显改变。结论:这些基因的表达改变组成了一个食管癌特异的基因表达谱,为食管癌细胞的恶性表型提供了分子遗传学参考数据,一些与肿瘤发生相关的差异表达基因为发展生物标记物或肿瘤早期诊断和治疗提供了线索。第二部分食管鳞癌和正常食管黏膜组织中差异表达的基因与食管癌的临床病理以及预后的相关性研究目的:采用实时定量PCR方法检测食管癌样本中细胞分化调控相关基因β-catenin、wnt1、smad4、hoxa9、bmi-1基因mRNA的表达量,并分析其与临床资料之间的关系。方法:设计β-catenin、wnt1、smad4、hoxa9、bmi-1基因特异性探针和引物,建立β-catenin、wnt1、smad4、hoxa9、bmi-1基因实时定量检测方法;并检测40例食管癌患者(男28例,女12例,38-82岁,中位年龄60岁)肿瘤切除石蜡标本中β-catenin、wnt1、smad4、hoxa9、bmi-1基因mRNA的模板拷贝数,以beta-actin为内参得出校正过的基因表达相对值。统计学分析这些值与临床病理及预后的关系。结果:β-catenin、wnt1、smad4的mRNA表达水平与性别、年龄、病理亚型无关(P>0.05);与淋巴结转移、细胞分化和病理分期有关(P<0.05)。hoxa9、bmi-1表达水平与性别、年龄、淋巴结转移以及病理亚型无关(P>0.05),与细胞分化和病理分期有关(P<0.05)。β-catenin高表达的患者预后较低表达者差(P=0.024)。结论:食管癌中β-catenin、wnt1、smad4 mRNA表达的可作为预测淋巴结转移、评价预后的一个重要指标。
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