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广东湛江红树林国家级自然保护区是我国最大的红树林自然保护区之一，是许多鱼类的栖息场所。为追踪了解湛江红树林区鱼类资源状况，本研究采集湛江西部红树林区高桥、流沙、北谭三个站点的鱼类，利用形态学和线粒体COⅠ基因的DNA条形码技术对按月采集的样本进行物种鉴定，并探讨时空分布规律。主要研究结论如下：（1）利用不同网具（围网、笼网、浅水浮游生物Ⅰ型网、手抄网等）在三个站点共采集到67类成鱼，18类稚幼鱼。（2）采用形态学分类的方法鉴定出26种成鱼，隶属于5目18科22属。基于形态数据对26种成鱼进行的聚类结果与分类关系基本吻合。（3）扩增、测定了59个物种147个成鱼样本和18种稚幼鱼50个样本的COⅠ序列：基于COⅠ序列从成鱼样本中鉴定出59种，隶属于9目26科44属，其中鲈形目物种数最多，鰕虎鱼亚目物种数占鲈形目物种数的39.47%，达15种；从稚幼鱼样本鉴定出18种，隶属于2目8科12属，仍然以鲈形目物种最多，含鰕虎鱼亚目鱼类7种。（4）采用邻接法构建59种成鱼和18种稚幼鱼分子系统进化树表明来自于不同时间不同采样地点不同发育时期的同个物种均能较好地聚在一起，且置信度较高。在鰕虎鱼亚目中，爪哇拟鰕虎鱼(Pseudogobius javanicus)与其他鰕虎鱼的亲缘关系较远；双带缟鰕虎鱼（Tridentiger bifasciatus）与纹缟鰕虎鱼（Tridentiger trigonocephalus）的亲缘关系最为密切。（5）时空分布规律分析表明：湛江西部红树林区每年4月—6月和9月—10月两个时间段的红树林区鱼类种数最多；三个采样点的成鱼和稚幼鱼优势鱼种具有较大差异。高桥、流沙湾和北潭红树林区的成鱼优势种分别为金钱鱼（Scatophagusargus），细鳞鯻（Terapon jarbua），玛丽双边鱼（Ambassis marianus）；稚幼优势种分别为小口拟鰕虎鱼（Pseudogobius masago）、细鳞鯻（Terapon jarbua）、玛丽双边鱼（Ambassis marianus）。总体而言，高桥与北潭两个采样点的鱼种相似度较高。